RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493316.5

CFAP74-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 74, human

TSL 4

Gene CFAP74, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP74-208	ENST00000493316	SIRT1	Q96EB6	747 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	PRAM1	Q96QH2	718 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316		A0A0G2JS52	829 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	MYT1	Q01538	1121 aa		11.26	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	SBF2	Q86WG5	1849 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	IFFO2	Q5TF58	517 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	SBNO1	A3KN83	1393 aa		11.25	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		11.24	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	BTG4	Q9NY30	223 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	ATP7B	P35670	1465 aa		11.23	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	ARHGEF10	O15013	1369 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	STAC3	Q96MF2	364 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	POGK	Q9P215	609 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		11.22	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	PSME1	Q06323	249 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CFAP74-208	ENST00000493316	LRRC37A3	O60309	1634 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	CHRNA2	Q15822	529 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	PEAK1	Q9H792	1746 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	AKAP12	Q02952	1782 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	KIAA0232	Q92628	1395 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	CASZ1	Q86V15	1759 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	SPON1	Q9HCB6	807 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	MYOM1	P52179	1685 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	TRIM37	O94972	964 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	COL18A1	P39060	1754 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	PIK3C2A	O00443	1686 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	STRN4	Q9NRL3	753 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CFAP74-208	ENST00000493316	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	UTRN	P46939	3433 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	USP35	Q9P2H5	1018 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	SSH2	Q76I76	1423 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	KCNQ2	O43526	872 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	APBA3	O96018	575 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	CDK19	Q9BWU1	502 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CFAP74-208	ENST00000493316	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	NEUROD1	Q13562	356 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	SLIT3	O75094	1523 aa		11.08	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	CHD4	Q14839	1912 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	LTN1	O94822	1766 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	ACE	P12821	1306 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	USP19	O94966	1318 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	BTAF1	O14981	1849 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CFAP74-208	ENST00000493316	PDE3B	Q13370	1112 aa		11.05	□□□□□ -0.64

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