RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474293.2

SOGA3-206, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SOGA3, Length 772 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-206ENST00000474293 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
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SOGA3-206ENST00000474293 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SOGA3-206ENST00000474293 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.98■■□□□ 1.11
SOGA3-206ENST00000474293 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.98■■□□□ 1.11
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SOGA3-206ENST00000474293 USP35Q9P2H5 1018 aa21.97■■□□□ 1.11
SOGA3-206ENST00000474293 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SOGA3-206ENST00000474293 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.94■■□□□ 1.1
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SOGA3-206ENST00000474293 CHRNA2Q15822 529 aa21.94■■□□□ 1.1
SOGA3-206ENST00000474293 RREB1Q92766 1687 aa21.94■■□□□ 1.1
SOGA3-206ENST00000474293 C1QTNF8P60827 252 aa21.93■■□□□ 1.1
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SOGA3-206ENST00000474293 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SOGA3-206ENST00000474293 IFT172Q9UG01 1749 aa21.93■■□□□ 1.1
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SOGA3-206ENST00000474293 PRAM1Q96QH2 718 aa21.91■■□□□ 1.1
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SOGA3-206ENST00000474293 KIAA0232Q92628 1395 aa21.87■■□□□ 1.09
SOGA3-206ENST00000474293 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.87■■□□□ 1.09
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SOGA3-206ENST00000474293 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.84■■□□□ 1.09
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SOGA3-206ENST00000474293 POGKQ9P215 609 aa21.84■■□□□ 1.09
SOGA3-206ENST00000474293 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.83■■□□□ 1.09
SOGA3-206ENST00000474293 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.83■■□□□ 1.09
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SOGA3-206ENST00000474293 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.82■■□□□ 1.08
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SOGA3-206ENST00000474293 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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SOGA3-206ENST00000474293 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.81■■□□□ 1.08
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SOGA3-206ENST00000474293 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.8■■□□□ 1.08
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SOGA3-206ENST00000474293 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.78■■□□□ 1.08
SOGA3-206ENST00000474293 SYT17Q9BSW7 474 aa21.78■■□□□ 1.08
SOGA3-206ENST00000474293 SSH2Q76I76 1423 aa21.78■■□□□ 1.08
SOGA3-206ENST00000474293 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.77■■□□□ 1.08
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SOGA3-206ENST00000474293 PROM2Q8N271 834 aa21.71■■□□□ 1.07
SOGA3-206ENST00000474293 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.71■■□□□ 1.07
SOGA3-206ENST00000474293 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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SOGA3-206ENST00000474293 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.67■■□□□ 1.06
SOGA3-206ENST00000474293 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.67■■□□□ 1.06
SOGA3-206ENST00000474293 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.67■■□□□ 1.06
SOGA3-206ENST00000474293 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SOGA3-206ENST00000474293 STK32BQ9NY57 414 aa21.66■■□□□ 1.06
SOGA3-206ENST00000474293 DLC1Q96QB1 1528 aa21.65■■□□□ 1.06
SOGA3-206ENST00000474293 UTRNP46939 3433 aa21.65■■□□□ 1.06
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SOGA3-206ENST00000474293 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.62■■□□□ 1.05
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SOGA3-206ENST00000474293 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
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SOGA3-206ENST00000474293 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SOGA3-206ENST00000474293 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.57■■□□□ 1.04
SOGA3-206ENST00000474293 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SOGA3-206ENST00000474293 ACEP12821 1306 aa21.56■■□□□ 1.04
SOGA3-206ENST00000474293 CRB1P82279 1406 aa21.56■■□□□ 1.04
SOGA3-206ENST00000474293 KLHL34Q8N239 644 aa21.56■■□□□ 1.04
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