RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468254.5

CEP170-211, Transcript of centrosomal protein 170, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CEP170, Length 2,972 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170-211ENST00000468254 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa4.94□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa4.94□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 MYO3AQ8NEV4 1616 aa4.93□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa4.93□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 SLC34A2O95436 690 aa4.93□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 PSEN1P49768 467 aa4.93□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 KCNA1Q09470 495 aa4.93□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 SH3D19Q5HYK7 790 aa4.93□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 CFAP70Q5T0N1 1121 aa4.93□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa4.93□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 PPLO60437 1756 aa4.93□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 UGGT1Q9NYU2 1555 aa4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 GNPATO15228 680 aa4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 PDE4AP27815 886 aa4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 MADDQ8WXG6 1647 aa4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 PREX1Q8TCU6 1659 aa4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 IQGAP1P46940 1657 aa4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 A2MP01023 1474 aa4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 NRXN1Q9ULB1 1477 aa4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 BEGAINQ9BUH8 593 aa4.92□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 ABCC3O15438 1527 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 MYOM2P54296 1465 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 SPATA32Q96LK8 384 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 STAC3Q96MF2 364 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 CLEC11AQ9Y240 323 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 ADGRB3O60242 1522 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 KIF15Q9NS87 1388 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 GIPC2Q8TF65 315 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa4.91□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 TMEM88BA6NKF7 163 aa4.9□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 RFC5P40937 340 aa4.9□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa4.9□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 C9orf131Q5VYM1 1079 aa4.9□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 DDX12PQ92771 950 aa4.9□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 CLTCL1P53675 1640 aa4.9□□□□□ -1.62
CEP170-211ENST00000468254 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 SPDYE5A6NIY4 337 aa4.9□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa4.9□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 TCF3P15923 654 aa4.9□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 SCAPERQ9BY12 1400 aa4.9□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 TBC1D12O60347 775 aa4.89□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 KNDC1Q76NI1 1749 aa4.89□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 ANKRD62A6NC57 917 aa4.89□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 TAF7LQ5H9L4 462 aa4.89□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa4.89□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 NOS1P29475 1434 aa4.89□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 RALGAPBQ86X10 1494 aa4.89□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 PDIA6Q15084 440 aa4.89□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 MYSM1Q5VVJ2 828 aa4.89□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.89□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.89□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 CNTLNQ9NXG0 1405 aa4.89□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 PLA2R1Q13018 1463 aa4.88□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 VTI1AQ96AJ9 217 aa4.88□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 SYNMO15061 1565 aa4.88□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 ZFYVE9O95405 1425 aa4.88□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 PRAG1Q86YV5 1406 aa4.88□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 MARCH6O60337 910 aa4.88□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 LIMD1Q9UGP4 676 aa4.88□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 ADAMTSL3P82987 1691 aa4.87□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa4.87□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa4.87□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 NLRP6P59044 892 aa4.87□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 DRC1Q96MC2 740 aa4.87□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 PSMD1Q99460 953 aa4.87□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 BCL2L13Q9BXK5 485 aa4.87□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 GPRASP1Q5JY77 1395 aa4.87□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 OSBPP22059 807 aa4.86□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 DSG2Q14126 1118 aa4.86□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 TSPOAP1O95153 1857 aa4.86□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 TSPY4P0CV99 314 aa4.86□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 TSPY10P0CW01 314 aa4.86□□□□□ -1.63
CEP170-211ENST00000468254 SERPINB4P48594 390 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms