RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462791.1

NRXN1-215, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 4

Gene NRXN1, Length 490 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-215ENST00000462791 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.39□□□□□ -1.23
NRXN1-215ENST00000462791 CABP2Q9NPB3 220 aa7.39□□□□□ -1.23
NRXN1-215ENST00000462791 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.39□□□□□ -1.23
NRXN1-215ENST00000462791 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.39□□□□□ -1.23
NRXN1-215ENST00000462791 GNPATO15228 680 aa7.38□□□□□ -1.23
NRXN1-215ENST00000462791 HOXA2O43364 376 aa7.38□□□□□ -1.23
NRXN1-215ENST00000462791 GYS2P54840 703 aa7.38□□□□□ -1.23
NRXN1-215ENST00000462791 BIRC2Q13490 618 aa7.38□□□□□ -1.23
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NRXN1-215ENST00000462791 PRC1O43663 620 aa7.31□□□□□ -1.24
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NRXN1-215ENST00000462791 NRDCO43847 1150 aa7.3□□□□□ -1.24
NRXN1-215ENST00000462791 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NRXN1-215ENST00000462791 EVA1CP58658 441 aa7.3□□□□□ -1.24
NRXN1-215ENST00000462791 CCDC96Q2M329 555 aa7.3□□□□□ -1.24
NRXN1-215ENST00000462791 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
NRXN1-215ENST00000462791 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NRXN1-215ENST00000462791 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.3□□□□□ -1.24
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