RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-211ENST00000462351 GRPEL1Q9HAV7 217 aa17.31■□□□□ 0.36
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PTPRN-211ENST00000462351 TRDNQ13061 729 aa17.3■□□□□ 0.36
PTPRN-211ENST00000462351 TTLL5Q6EMB2 1281 aa17.3■□□□□ 0.36
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PTPRN-211ENST00000462351 SMARCE1Q969G3 411 aa17.29■□□□□ 0.36
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PTPRN-211ENST00000462351 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.27■□□□□ 0.36
PTPRN-211ENST00000462351 FILIP1LQ4L180 1135 aa17.27■□□□□ 0.36
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PTPRN-211ENST00000462351 ZSCAN30Q86W11 494 aa17.25■□□□□ 0.35
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PTPRN-211ENST00000462351 ROCK1Q13464 1354 aa17.25■□□□□ 0.35
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PTPRN-211ENST00000462351 CENPHQ9H3R5 247 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRN-211ENST00000462351 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.24■□□□□ 0.35
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PTPRN-211ENST00000462351 CCDC192P0DO97 292 aa17.23■□□□□ 0.35
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PTPRN-211ENST00000462351 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa17.22■□□□□ 0.35
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PTPRN-211ENST00000462351 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa17.21■□□□□ 0.35
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PTPRN-211ENST00000462351 RABEP1Q15276 862 aa17.2■□□□□ 0.34
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PTPRN-211ENST00000462351 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa17.19■□□□□ 0.34
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PTPRN-211ENST00000462351 ZMYND15Q9H091 742 aa17.19■□□□□ 0.34
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PTPRN-211ENST00000462351 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.19■□□□□ 0.34
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PTPRN-211ENST00000462351 CFAP70Q5T0N1 1121 aa17.18■□□□□ 0.34
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PTPRN-211ENST00000462351 PRDM10Q9NQV6 1147 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 SERPINC1P01008 464 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 MCM4P33991 863 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC181Q5TID7 509 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 GBP3Q9H0R5 595 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 NBPF1Q3BBV0 1214 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 GRIN2AQ12879 1464 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 PPFIBP1Q86W92 1011 aa17.15■□□□□ 0.34
PTPRN-211ENST00000462351 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
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