RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444999.5

UPP1-209, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 869 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-209ENST00000444999 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.79■■□□□ 1.88
UPP1-209ENST00000444999 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.79■■□□□ 1.88
UPP1-209ENST00000444999 ACEP12821 1306 aa26.78■■□□□ 1.88
UPP1-209ENST00000444999 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
UPP1-209ENST00000444999 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.76■■□□□ 1.88
UPP1-209ENST00000444999 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.75■■□□□ 1.87
UPP1-209ENST00000444999 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.75■■□□□ 1.87
UPP1-209ENST00000444999 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
UPP1-209ENST00000444999 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
UPP1-209ENST00000444999 CABP2Q9NPB3 220 aa26.74■■□□□ 1.87
UPP1-209ENST00000444999 BTG4Q9NY30 223 aa26.74■■□□□ 1.87
UPP1-209ENST00000444999 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.74■■□□□ 1.87
UPP1-209ENST00000444999 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.73■■□□□ 1.87
UPP1-209ENST00000444999 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.73■■□□□ 1.87
UPP1-209ENST00000444999 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.72■■□□□ 1.87
UPP1-209ENST00000444999 NRAPQ86VF7 1730 aa26.72■■□□□ 1.87
UPP1-209ENST00000444999 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
UPP1-209ENST00000444999 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.7■■□□□ 1.86
UPP1-209ENST00000444999 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
UPP1-209ENST00000444999 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.68■■□□□ 1.86
UPP1-209ENST00000444999 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.67■■□□□ 1.86
UPP1-209ENST00000444999 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
UPP1-209ENST00000444999 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
UPP1-209ENST00000444999 KIAA0232Q92628 1395 aa26.66■■□□□ 1.86
UPP1-209ENST00000444999 CHRNA2Q15822 529 aa26.64■■□□□ 1.86
UPP1-209ENST00000444999 ABTB2Q8N961 1025 aa26.64■■□□□ 1.86
UPP1-209ENST00000444999 CABP1Q9NZU7 370 aa26.64■■□□□ 1.86
UPP1-209ENST00000444999 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
UPP1-209ENST00000444999 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
UPP1-209ENST00000444999 CCDC125Q86Z20 511 aa26.62■■□□□ 1.85
UPP1-209ENST00000444999 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.61■■□□□ 1.85
UPP1-209ENST00000444999 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.61■■□□□ 1.85
UPP1-209ENST00000444999 A0A0G2JS52 829 aa26.6■■□□□ 1.85
UPP1-209ENST00000444999 MYT1Q01538 1121 aa26.6■■□□□ 1.85
UPP1-209ENST00000444999 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.6■■□□□ 1.85
UPP1-209ENST00000444999 EVC2Q86UK5 1308 aa26.6■■□□□ 1.85
UPP1-209ENST00000444999 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.58■■□□□ 1.85
UPP1-209ENST00000444999 USP19O94966 1318 aa26.57■■□□□ 1.84
UPP1-209ENST00000444999 STRN4Q9NRL3 753 aa26.56■■□□□ 1.84
UPP1-209ENST00000444999 USP6P35125 1406 aa26.56■■□□□ 1.84
UPP1-209ENST00000444999 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
UPP1-209ENST00000444999 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
UPP1-209ENST00000444999 NLRP13Q86W25 1043 aa26.54■■□□□ 1.84
UPP1-209ENST00000444999 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.53■■□□□ 1.84
UPP1-209ENST00000444999 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
UPP1-209ENST00000444999 GCP02774 474 aa26.52■■□□□ 1.84
UPP1-209ENST00000444999 SSH2Q76I76 1423 aa26.52■■□□□ 1.84
UPP1-209ENST00000444999 CPDO75976 1380 aa26.51■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 TONSLQ96HA7 1378 aa26.51■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.51■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.51■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.5■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.5■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 FAM182BQ5T319 152 aa26.5■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.5■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 NLRP6P59044 892 aa26.49■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.48■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 EVA1CP58658 441 aa26.48■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 USP35Q9P2H5 1018 aa26.47■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.46■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 PIK3C2AO00443 1686 aa26.46■■□□□ 1.83
UPP1-209ENST00000444999 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.44■■□□□ 1.82
UPP1-209ENST00000444999 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
UPP1-209ENST00000444999 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.44■■□□□ 1.82
UPP1-209ENST00000444999 SLIT3O75094 1523 aa26.44■■□□□ 1.82
UPP1-209ENST00000444999 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.43■■□□□ 1.82
UPP1-209ENST00000444999 AKAP12Q02952 1782 aa26.43■■□□□ 1.82
UPP1-209ENST00000444999 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
UPP1-209ENST00000444999 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
UPP1-209ENST00000444999 BARGINQ6ZT62 677 aa26.39■■□□□ 1.82
UPP1-209ENST00000444999 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
UPP1-209ENST00000444999 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.37■■□□□ 1.81
UPP1-209ENST00000444999 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.37■■□□□ 1.81
UPP1-209ENST00000444999 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.37■■□□□ 1.81
UPP1-209ENST00000444999 BAG6P46379 1132 aa26.35■■□□□ 1.81
UPP1-209ENST00000444999 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.35■■□□□ 1.81
UPP1-209ENST00000444999 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.35■■□□□ 1.81
UPP1-209ENST00000444999 SOX12O15370 315 aa26.34■■□□□ 1.81
UPP1-209ENST00000444999 COL18A1P39060 1754 aa26.33■■□□□ 1.81
UPP1-209ENST00000444999 TMC1Q8TDI8 760 aa26.33■■□□□ 1.81
UPP1-209ENST00000444999 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.33■■□□□ 1.81
UPP1-209ENST00000444999 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.33■■□□□ 1.81
UPP1-209ENST00000444999 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.32■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.32■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 CRB1P82279 1406 aa26.31■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 PDE3BQ13370 1112 aa26.31■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.31■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 TRIM37O94972 964 aa26.3■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.3■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.29■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 TESK2Q96S53 571 aa26.29■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 NME9Q86XW9 330 aa26.28■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 NFAT5O94916 1531 aa26.28■■□□□ 1.8
UPP1-209ENST00000444999 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms