RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 RGPD1P0DJD0 1748 aa17.05■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 TULP4Q9NRJ4 1543 aa17.05■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa17.04■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa17.04■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 ADGRB1O14514 1584 aa17.02■□□□□ 0.32
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PRAME-210ENST00000442481 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa17.02■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 PRR36Q9H6K5 1346 aa17.02■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
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PRAME-210ENST00000442481 TRAK1Q9UPV9 953 aa17.02■□□□□ 0.32
PRAME-210ENST00000442481 ITSN1Q15811 1721 aa17.01■□□□□ 0.31
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PRAME-210ENST00000442481 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa16.96■□□□□ 0.3
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PRAME-210ENST00000442481 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.94■□□□□ 0.3
PRAME-210ENST00000442481 KIAA0232Q92628 1395 aa16.93■□□□□ 0.3
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PRAME-210ENST00000442481 NBPF14Q5TI25 921 aa16.88■□□□□ 0.29
PRAME-210ENST00000442481 NUTM2GQ5VZR2 741 aa16.88■□□□□ 0.29
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PRAME-210ENST00000442481 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
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PRAME-210ENST00000442481 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.85■□□□□ 0.29
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.84■□□□□ 0.29
PRAME-210ENST00000442481 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PRAME-210ENST00000442481 NLRP13Q86W25 1043 aa16.84■□□□□ 0.29
PRAME-210ENST00000442481 LMO7Q8WWI1 1683 aa16.84■□□□□ 0.29
PRAME-210ENST00000442481 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa16.84■□□□□ 0.29
PRAME-210ENST00000442481 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.83■□□□□ 0.28
PRAME-210ENST00000442481 YY1P25490 414 aa16.81■□□□□ 0.28
PRAME-210ENST00000442481 USP19O94966 1318 aa16.8■□□□□ 0.28
PRAME-210ENST00000442481 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
PRAME-210ENST00000442481 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PRAME-210ENST00000442481 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.78■□□□□ 0.28
PRAME-210ENST00000442481 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.78■□□□□ 0.28
PRAME-210ENST00000442481 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.78■□□□□ 0.28
PRAME-210ENST00000442481 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.78■□□□□ 0.28
PRAME-210ENST00000442481 GCP02774 474 aa16.77■□□□□ 0.28
PRAME-210ENST00000442481 SPON1Q9HCB6 807 aa16.77■□□□□ 0.28
PRAME-210ENST00000442481 CRB1P82279 1406 aa16.77■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 PEAK1Q9H792 1746 aa16.76■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa16.75■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 KCNQ2O43526 872 aa16.75■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 NINLQ9Y2I6 1382 aa16.75■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 AATKQ6ZMQ8 1374 aa16.74■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 DDB1Q16531 1140 aa16.73■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 LRRC37A3O60309 1634 aa16.73■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 PLSCR1O15162 318 aa16.72■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 NLRP6P59044 892 aa16.72■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.72■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 SBF2Q86WG5 1849 aa16.71■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 NEUROD1Q13562 356 aa16.71■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.71■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 CASZ1Q86V15 1759 aa16.71■□□□□ 0.27
PRAME-210ENST00000442481 USP6P35125 1406 aa16.7■□□□□ 0.26
PRAME-210ENST00000442481 ZBTB7CA1YPR0 619 aa16.7■□□□□ 0.26
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