RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 BAG6P46379 1132 aa26.96■■□□□ 1.91
UPK3BP1-201ENST00000428678 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
UPK3BP1-201ENST00000428678 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
UPK3BP1-201ENST00000428678 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
UPK3BP1-201ENST00000428678 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.93■■□□□ 1.9
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRP5O75197 1615 aa26.91■■□□□ 1.9
UPK3BP1-201ENST00000428678 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.9■■□□□ 1.9
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.9■■□□□ 1.9
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM182BQ5T319 152 aa26.89■■□□□ 1.9
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.89■■□□□ 1.9
UPK3BP1-201ENST00000428678 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.89■■□□□ 1.9
UPK3BP1-201ENST00000428678 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.87■■□□□ 1.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 ITSN1Q15811 1721 aa26.85■■□□□ 1.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.84■■□□□ 1.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 HRCP23327 699 aa26.83■■□□□ 1.89
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP7BP35670 1465 aa26.82■■□□□ 1.88
UPK3BP1-201ENST00000428678 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
UPK3BP1-201ENST00000428678 STAC3Q96MF2 364 aa26.82■■□□□ 1.88
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIAA0232Q92628 1395 aa26.82■■□□□ 1.88
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHRNA2Q15822 529 aa26.81■■□□□ 1.88
UPK3BP1-201ENST00000428678 STRN4Q9NRL3 753 aa26.79■■□□□ 1.88
UPK3BP1-201ENST00000428678 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
UPK3BP1-201ENST00000428678 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.78■■□□□ 1.88
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
UPK3BP1-201ENST00000428678 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.77■■□□□ 1.88
UPK3BP1-201ENST00000428678 DISP2A7MBM2 1401 aa26.76■■□□□ 1.87
UPK3BP1-201ENST00000428678 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDK19Q9BWU1 502 aa26.75■■□□□ 1.87
UPK3BP1-201ENST00000428678 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM37O94972 964 aa26.72■■□□□ 1.87
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.72■■□□□ 1.87
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP35Q9P2H5 1018 aa26.72■■□□□ 1.87
UPK3BP1-201ENST00000428678 ACEP12821 1306 aa26.71■■□□□ 1.87
UPK3BP1-201ENST00000428678 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.71■■□□□ 1.87
UPK3BP1-201ENST00000428678 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
UPK3BP1-201ENST00000428678 EVA1CP58658 441 aa26.7■■□□□ 1.86
UPK3BP1-201ENST00000428678 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.69■■□□□ 1.86
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.69■■□□□ 1.86
UPK3BP1-201ENST00000428678 SSH2Q76I76 1423 aa26.68■■□□□ 1.86
UPK3BP1-201ENST00000428678 APBA3O96018 575 aa26.67■■□□□ 1.86
UPK3BP1-201ENST00000428678 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.67■■□□□ 1.86
UPK3BP1-201ENST00000428678 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.67■■□□□ 1.86
UPK3BP1-201ENST00000428678 PDE3BQ13370 1112 aa26.66■■□□□ 1.86
UPK3BP1-201ENST00000428678 ABTB2Q8N961 1025 aa26.66■■□□□ 1.86
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.65■■□□□ 1.86
UPK3BP1-201ENST00000428678 BARGINQ6ZT62 677 aa26.64■■□□□ 1.86
UPK3BP1-201ENST00000428678 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.63■■□□□ 1.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.63■■□□□ 1.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.62■■□□□ 1.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 CPDO75976 1380 aa26.61■■□□□ 1.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.61■■□□□ 1.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP19O94966 1318 aa26.61■■□□□ 1.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.6■■□□□ 1.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.58■■□□□ 1.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 NLRP13Q86W25 1043 aa26.58■■□□□ 1.85
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.57■■□□□ 1.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 RREB1Q92766 1687 aa26.57■■□□□ 1.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 GCP02774 474 aa26.56■■□□□ 1.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.56■■□□□ 1.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.54■■□□□ 1.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 CABP2Q9NPB3 220 aa26.54■■□□□ 1.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 NBPF14Q5TI25 921 aa26.53■■□□□ 1.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
UPK3BP1-201ENST00000428678 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.49■■□□□ 1.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 CRB1P82279 1406 aa26.48■■□□□ 1.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 NLRP6P59044 892 aa26.47■■□□□ 1.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP6P35125 1406 aa26.47■■□□□ 1.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 CABP1Q9NZU7 370 aa26.46■■□□□ 1.83
UPK3BP1-201ENST00000428678 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.45■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.45■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.45■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.44■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLIT3O75094 1523 aa26.43■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRRC37A3O60309 1634 aa26.42■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 PEAK1Q9H792 1746 aa26.42■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.41■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPON1Q9HCB6 807 aa26.41■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 DDB1Q16531 1140 aa26.4■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 PIK3C2AO00443 1686 aa26.4■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 SBF2Q86WG5 1849 aa26.39■■□□□ 1.82
UPK3BP1-201ENST00000428678 KCNQ2O43526 872 aa26.37■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 COL18A1P39060 1754 aa26.37■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.37■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 EVC2Q86UK5 1308 aa26.37■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.35■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
UPK3BP1-201ENST00000428678 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms