RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 TIGD1Q96MW7 591 aa13.38□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHMP5Q9NZZ3 219 aa13.38□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYRIPQ8NFW9 859 aa13.37□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.37□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 CFAP70Q5T0N1 1121 aa13.37□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.36□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLUAP1Q96AJ1 413 aa13.36□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF521Q96K83 1311 aa13.36□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa13.35□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 PREX2Q70Z35 1606 aa13.35□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDCL2Q8N4E4 241 aa13.35□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC66A2RUB6 948 aa13.34□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
APOBEC3C-201ENST00000361441 CARD14Q9BXL6 1004 aa13.33□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP13.33□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTMSP20962 102 aa13.33□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 HS1BP3Q53T59 392 aa13.32□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.32□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTMAP06454 111 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa13.32□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERICH4A6NGS2 130 aa13.31□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 YY1AP1Q9H869 796 aa13.31□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIF3AQ9Y496 699 aa13.31□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 UNC13BO14795 1591 aa13.31□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 TULP2O00295 520 aa13.3□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.3□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.3□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMX1Q9H3N1 280 aa13.29□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.29□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIF3BO15066 747 aa13.29□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLFN14P0C7P3 912 aa13.29□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 RLBP1P12271 317 aa13.29□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 BANK1Q8NDB2 785 aa13.29□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.28□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.28□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.28□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.27□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 CARD10Q9BWT7 1032 aa13.27□□□□□ -0.28
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.27□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 MADDQ8WXG6 1647 aa13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 NLRP1Q9C000 1473 aa13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 GRIPAP1Q4V328 841 aa13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 TMEM132EQ6IEE7 984 aa13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 TBC1D32Q96NH3 1257 aa13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDCA8Q53HL2 280 aa13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 SIRT1Q96EB6 747 aa13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 CFAP44Q96MT7 982 aa13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRIMPOLQ96LW4 560 aa13.25□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa13.25□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP10AO60312 1499 aa13.24□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.24□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 MORC1Q86VD1 984 aa13.24□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDLIM2Q96JY6 352 aa13.24□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 MCM5P33992 734 aa13.24□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 LAMC1P11047 1609 aa13.24□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 TICAM2Q86XR7 235 aa13.23□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 GBP4Q96PP9 640 aa13.23□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 OGFRQ9NZT2 677 aa13.23□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.23□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.23□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 RSPH14Q9UHP6 348 aa13.23□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIK3C2GO75747 1445 aa13.23□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 EGFL6Q8IUX8 553 aa13.22□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 MPNDQ8N594 471 aa13.22□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSPYL1Q9H0U9 437 aa13.22□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBSNQ9H1K0 784 aa13.22□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 EFCC1Q9HA90 598 aa13.22□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLTCL1P53675 1640 aa13.22□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
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