RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356455.8

UBE2C-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2C, Length 850 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-204ENST00000356455 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.29■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 DLC1Q96QB1 1528 aa27.28■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 DISP2A7MBM2 1401 aa27.27■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 ALS2Q96Q42 1657 aa27.27■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 ADGRB2O60241 1585 aa27.26■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.26■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 TRIM37O94972 964 aa27.25■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.24■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.23■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.23■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.22■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 STRN4Q9NRL3 753 aa27.22■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.21■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 APBA3O96018 575 aa27.21■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.2■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 CHRNA2Q15822 529 aa27.19■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 KIAA0232Q92628 1395 aa27.18■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 USP35Q9P2H5 1018 aa27.17■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.16■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 ADGRB1O14514 1584 aa27.15■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.15■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 YY1P25490 414 aa27.14■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 EVA1CP58658 441 aa27.14■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 PDE3BQ13370 1112 aa27.14■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.12■■□□□ 1.93
UBE2C-204ENST00000356455 NBPF14Q5TI25 921 aa27.12■■□□□ 1.93
UBE2C-204ENST00000356455 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.12■■□□□ 1.93
UBE2C-204ENST00000356455 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.11■■□□□ 1.93
UBE2C-204ENST00000356455 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
UBE2C-204ENST00000356455 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
UBE2C-204ENST00000356455 BARGINQ6ZT62 677 aa27.07■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.06■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 ATP7BP35670 1465 aa27.06■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 ITSN1Q15811 1721 aa27.05■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.05■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 SSH2Q76I76 1423 aa27.05■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 RREB1Q92766 1687 aa27.05■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.03■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.02■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 SPON1Q9HCB6 807 aa27.02■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 CDK19Q9BWU1 502 aa26.99■■□□□ 1.91
UBE2C-204ENST00000356455 ACEP12821 1306 aa26.98■■□□□ 1.91
UBE2C-204ENST00000356455 KCNQ2O43526 872 aa26.98■■□□□ 1.91
UBE2C-204ENST00000356455 ABTB2Q8N961 1025 aa26.98■■□□□ 1.91
UBE2C-204ENST00000356455 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.97■■□□□ 1.91
UBE2C-204ENST00000356455 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.94■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 STAC3Q96MF2 364 aa26.94■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.94■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 CPDO75976 1380 aa26.93■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.93■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.91■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.91■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.89■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.89■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 NLRP13Q86W25 1043 aa26.89■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 USP19O94966 1318 aa26.89■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 GCP02774 474 aa26.88■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.88■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.87■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.87■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.87■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 CRB1P82279 1406 aa26.84■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 PLSCR1O15162 318 aa26.83■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 DDB1Q16531 1140 aa26.82■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.8■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.79■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 ZBTB7AO95365 584 aa26.78■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 PEAK1Q9H792 1746 aa26.78■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.77■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 NLRP6P59044 892 aa26.77■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 LRRC37A3O60309 1634 aa26.76■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 CABP2Q9NPB3 220 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 SBF2Q86WG5 1849 aa26.74■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 CASZ1Q86V15 1759 aa26.74■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 STK32BQ9NY57 414 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 PROM2Q8N271 834 aa26.71■■□□□ 1.87
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