RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356455.8

UBE2C-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2C, Length 850 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-204ENST00000356455 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.29■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 DLC1Q96QB1 1528 aa27.28■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 DISP2A7MBM2 1401 aa27.27■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 ALS2Q96Q42 1657 aa27.27■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 ADGRB2O60241 1585 aa27.26■■□□□ 1.96
UBE2C-204ENST00000356455 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.26■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 TRIM37O94972 964 aa27.25■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.24■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.23■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.23■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.22■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 STRN4Q9NRL3 753 aa27.22■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.21■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 APBA3O96018 575 aa27.21■■□□□ 1.95
UBE2C-204ENST00000356455 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.2■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 CHRNA2Q15822 529 aa27.19■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 KIAA0232Q92628 1395 aa27.18■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 USP35Q9P2H5 1018 aa27.17■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.16■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 ADGRB1O14514 1584 aa27.15■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.15■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 YY1P25490 414 aa27.14■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 EVA1CP58658 441 aa27.14■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 PDE3BQ13370 1112 aa27.14■■□□□ 1.94
UBE2C-204ENST00000356455 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.12■■□□□ 1.93
UBE2C-204ENST00000356455 NBPF14Q5TI25 921 aa27.12■■□□□ 1.93
UBE2C-204ENST00000356455 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.12■■□□□ 1.93
UBE2C-204ENST00000356455 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.11■■□□□ 1.93
UBE2C-204ENST00000356455 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
UBE2C-204ENST00000356455 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
UBE2C-204ENST00000356455 BARGINQ6ZT62 677 aa27.07■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.06■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 ATP7BP35670 1465 aa27.06■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 ITSN1Q15811 1721 aa27.05■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.05■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 SSH2Q76I76 1423 aa27.05■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 RREB1Q92766 1687 aa27.05■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.03■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.02■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 SPON1Q9HCB6 807 aa27.02■■□□□ 1.92
UBE2C-204ENST00000356455 CDK19Q9BWU1 502 aa26.99■■□□□ 1.91
UBE2C-204ENST00000356455 ACEP12821 1306 aa26.98■■□□□ 1.91
UBE2C-204ENST00000356455 KCNQ2O43526 872 aa26.98■■□□□ 1.91
UBE2C-204ENST00000356455 ABTB2Q8N961 1025 aa26.98■■□□□ 1.91
UBE2C-204ENST00000356455 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.97■■□□□ 1.91
UBE2C-204ENST00000356455 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.94■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 STAC3Q96MF2 364 aa26.94■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.94■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 CPDO75976 1380 aa26.93■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 NINLQ9Y2I6 1382 aa26.93■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.91■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.91■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.89■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.89■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 NLRP13Q86W25 1043 aa26.89■■□□□ 1.9
UBE2C-204ENST00000356455 USP19O94966 1318 aa26.89■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 GCP02774 474 aa26.88■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.88■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.87■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.87■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.87■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 CRB1P82279 1406 aa26.84■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 PLSCR1O15162 318 aa26.83■■□□□ 1.89
UBE2C-204ENST00000356455 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 DDB1Q16531 1140 aa26.82■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.8■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.79■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 ZBTB7AO95365 584 aa26.78■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 PEAK1Q9H792 1746 aa26.78■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.77■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 NLRP6P59044 892 aa26.77■■□□□ 1.88
UBE2C-204ENST00000356455 LRRC37A3O60309 1634 aa26.76■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 CABP2Q9NPB3 220 aa26.75■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 SBF2Q86WG5 1849 aa26.74■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 CASZ1Q86V15 1759 aa26.74■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 STK32BQ9NY57 414 aa26.72■■□□□ 1.87
UBE2C-204ENST00000356455 PROM2Q8N271 834 aa26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms