RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.77■■■□□ 2.04
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PTPRCAP-201ENST00000326294 AKAP12Q02952 1782 aa27.73■■■□□ 2.03
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SSH2Q76I76 1423 aa27.67■■■□□ 2.02
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PTPRCAP-201ENST00000326294 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.52■■■□□ 2
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC24A1O60721 1099 aa27.5■■□□□ 1.99
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PTPRCAP-201ENST00000326294 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
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PTPRCAP-201ENST00000326294 NFAT5O94916 1531 aa27.43■■□□□ 1.98
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYOM1P52179 1685 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL18A1P39060 1754 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP31Q70CQ4 1352 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.4■■□□□ 1.98
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ZRANB1Q9UGI0 708 aa27.39■■□□□ 1.98
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
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PTPRCAP-201ENST00000326294 STRN4Q9NRL3 753 aa27.38■■□□□ 1.97
PTPRCAP-201ENST00000326294 AATKQ6ZMQ8 1374 aa27.37■■□□□ 1.97
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa27.36■■□□□ 1.97
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PTPRCAP-201ENST00000326294 EP400Q96L91 3159 aa27.34■■□□□ 1.97
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX12O15370 315 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGPD5Q99666 1765 aa27.32■■□□□ 1.96
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCC6O95255 1503 aa27.32■■□□□ 1.96
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.32■■□□□ 1.96
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PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PTPRCAP-201ENST00000326294 EVA1CP58658 441 aa27.31■■□□□ 1.96
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