RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
GLIS1-201ENST00000312233 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GLIS1-201ENST00000312233 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.52■■□□□ 1.04
GLIS1-201ENST00000312233 TULP2O00295 520 aa21.52■■□□□ 1.04
GLIS1-201ENST00000312233 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.51■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.51■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.5■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.5■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.5■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 LMBRD1Q9NUN5 540 aa21.5■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 MCTP1Q6DN14 999 aa21.49■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 ROCK1Q13464 1354 aa21.49■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.48■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.48■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.48■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.48■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.48■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.47■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.47■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.46■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.46■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 ABCC1P33527 1531 aa21.46■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.45■■□□□ 1.03
GLIS1-201ENST00000312233 FANCAO15360 1455 aa21.45■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 ADGRL2O95490 1459 aa21.45■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.44■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 MMP14P50281 582 aa21.44■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 PZPP20742 1482 aa21.43■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 KIF2CQ99661 725 aa21.43■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.43■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 TERF2Q15554 542 aa21.42■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 CD109Q6YHK3 1445 aa21.42■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 RNF214Q8ND24 703 aa21.42■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 GPT2Q8TD30 523 aa21.42■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 ZBTB9Q96C00 473 aa21.42■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 SYCE3A1L190 88 aa21.41■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 CTIFO43310 598 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.4■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 TSPY4P0CV99 314 aa21.4■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 TSPY10P0CW01 314 aa21.4■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 RLBP1P12271 317 aa21.4■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 CTNNA3Q9UI47 895 aa21.4■■□□□ 1.02
GLIS1-201ENST00000312233 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.39■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 MPNDQ8N594 471 aa21.39■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.39■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.39■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 SOX12O15370 315 aa21.38■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 TSPYL1Q9H0U9 437 aa21.38■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.37■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 AK9Q5TCS8 1911 aa21.37■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 NGEFQ8N5V2 710 aa21.37■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.37■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.37■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.37■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 DIP2BQ9P265 1576 aa21.37■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.37■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 YY1AP1Q9H869 796 aa21.37■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 TNNQ9UQP3 1299 aa21.37■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 APAF1O14727 1248 aa21.36■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 ADGRL1O94910 1474 aa21.36■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.36■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 PSEN1P49768 467 aa21.36■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 PPP2R1AP30153 589 aa21.35■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 GLI2P10070 1586 aa21.35■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.35■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.34■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.34■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.33■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 PLXNC1O60486 1568 aa21.33■■□□□ 1.01
GLIS1-201ENST00000312233 KIF16BQ96L93 1317 aa21.33■■□□□ 1
GLIS1-201ENST00000312233 NUCB2P80303 420 aa21.33■■□□□ 1
GLIS1-201ENST00000312233 AFAP1Q8N556 730 aa21.33■■□□□ 1
GLIS1-201ENST00000312233 ERICH4A6NGS2 130 aa21.32■■□□□ 1
GLIS1-201ENST00000312233 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.32■■□□□ 1
GLIS1-201ENST00000312233 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
GLIS1-201ENST00000312233 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
GLIS1-201ENST00000312233 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.3■■□□□ 1
GLIS1-201ENST00000312233 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.3■■□□□ 1
GLIS1-201ENST00000312233 PKD2Q13563 968 aa21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms