RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa43.47■■■■■ 4.55
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INO80B-201ENST00000233331 CABP1Q9NZU7 370 aa43.43■■■■■ 4.54
INO80B-201ENST00000233331 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa43.42■■■■■ 4.54
INO80B-201ENST00000233331 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
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INO80B-201ENST00000233331 BCL9LQ86UU0 1499 aa43.38■■■■■ 4.53
INO80B-201ENST00000233331 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa43.37■■■■■ 4.53
INO80B-201ENST00000233331 ATAD2Q6PL18 1390 aa43.36■■■■■ 4.53
INO80B-201ENST00000233331 ATRNO75882 1429 aa43.36■■■■■ 4.53
INO80B-201ENST00000233331 SLIT2O94813 1529 aa43.36■■■■■ 4.53
INO80B-201ENST00000233331 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
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INO80B-201ENST00000233331 PLCH1Q4KWH8 1693 aa43.32■■■■■ 4.53
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INO80B-201ENST00000233331 ABTB2Q8N961 1025 aa43.28■■■■■ 4.52
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INO80B-201ENST00000233331 RGS12O14924 1447 aa43.28■■■■■ 4.52
INO80B-201ENST00000233331 NWD2Q9ULI1 1742 aa43.25■■■■■ 4.51
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INO80B-201ENST00000233331 FAM83GA6ND36 823 aa43.24■■■■■ 4.51
INO80B-201ENST00000233331 AKAP12Q02952 1782 aa43.23■■■■■ 4.51
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INO80B-201ENST00000233331 USP19O94966 1318 aa43.16■■■■■ 4.5
INO80B-201ENST00000233331 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP43.15■■■■■ 4.5
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INO80B-201ENST00000233331 BTG4Q9NY30 223 aa43.13■■■■■ 4.49
INO80B-201ENST00000233331 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.49
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INO80B-201ENST00000233331 GLI3P10071 1580 aa43.12■■■■■ 4.49
INO80B-201ENST00000233331 PIK3C2AO00443 1686 aa43.11■■■■■ 4.49
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INO80B-201ENST00000233331 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa43.1■■■■■ 4.49
INO80B-201ENST00000233331 NLRP6P59044 892 aa43.09■■■■■ 4.49
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INO80B-201ENST00000233331 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa43.07■■■■■ 4.49
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INO80B-201ENST00000233331 A0A1W2PP64 1363 aa42.97■■■■■ 4.47
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INO80B-201ENST00000233331 NME9Q86XW9 330 aa42.87■■■■■ 4.45
INO80B-201ENST00000233331 SEPT12Q8IYM1 358 aa42.87■■■■■ 4.45
INO80B-201ENST00000233331 SOX12O15370 315 aa42.86■■■■■ 4.45
INO80B-201ENST00000233331 KCNH5Q8NCM2 988 aa42.85■■■■■ 4.45
INO80B-201ENST00000233331 ZRANB1Q9UGI0 708 aa42.85■■■■■ 4.45
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INO80B-201ENST00000233331 USP54Q70EL1 1684 aa42.83■■■■■ 4.45
INO80B-201ENST00000233331 A0A0G2JS52 829 aa42.83■■■■■ 4.45
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INO80B-201ENST00000233331 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa42.79■■■■■ 4.44
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INO80B-201ENST00000233331 ARHGEF25Q86VW2 580 aa42.75■■■■■ 4.43
INO80B-201ENST00000233331 COL18A1P39060 1754 aa42.75■■■■■ 4.43
INO80B-201ENST00000233331 USP35Q9P2H5 1018 aa42.73■■■■■ 4.43
INO80B-201ENST00000233331 MYOM1P52179 1685 aa42.72■■■■■ 4.43
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INO80B-201ENST00000233331 OVOS2Q6IE36 1432 aa42.71■■■■■ 4.43
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