RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000124246.3

Gt(ROSA)26Sor-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gt(ROSA)26Sor, Length 1,181 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Txnrd1Q9JMH6 613 aa30,46■■■□□ 2,47
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 NktrP30415 1453 aa30,45■■■□□ 2,47
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pola1P33609 1465 aa30,45■■■□□ 2,47
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rtl5Q5DTT4 599 aa30,44■■■□□ 2,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Robo1O89026 1612 aa30,44■■■□□ 2,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cacna1sQ02789 1880 aa30,43■■■□□ 2,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 PaskQ8CEE6 1383 aa30,41■■■□□ 2,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zmym3Q9JLM4 1370 aa30,41■■■□□ 2,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa30,41■■■□□ 2,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 HdgfP51859 237 aaKnown RBP30,4■■■□□ 2,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Neurod1Q60867 357 aa30,4■■■□□ 2,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Bcl9lQ67FY2 1494 aa30,39■■■□□ 2,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 TimelessQ9R1X4 1197 aa30,39■■■□□ 2,46
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sugp2Q8CH09 1067 aa30,38■■■□□ 2,45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Tet3Q8BG87 1668 aa30,36■■■□□ 2,45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dzip1Q8BMD2 852 aa30,35■■■□□ 2,45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 CenpjQ569L8 1344 aa30,35■■■□□ 2,45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mug2P28666 1451 aa30,34■■■□□ 2,45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Sbno1Q689Z5 1390 aa30,34■■■□□ 2,45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mier1Q5UAK0 511 aa30,34■■■□□ 2,45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ccdc129Q14B48 1034 aa30,33■■■□□ 2,45
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Stard8Q8K031 1019 aa30,32■■■□□ 2,44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fer1l6E0CZ42 1862 aa30,31■■■□□ 2,44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ly75Q60767 1723 aa30,31■■■□□ 2,44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gsto1O09131 240 aa30,31■■■□□ 2,44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa30,3■■■□□ 2,44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa30,3■■■□□ 2,44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa30,3■■■□□ 2,44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Card11Q8CIS0 1159 aa30,3■■■□□ 2,44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nid2O88322 1403 aa30,29■■■□□ 2,44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Idi2Q8BFZ6 227 aa30,28■■■□□ 2,44
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP30,24■■■□□ 2,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Srcin1Q9QWI6 1250 aa30,24■■■□□ 2,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kat6bQ8BRB7 1872 aa30,23■■■□□ 2,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP30,23■■■□□ 2,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa30,22■■■□□ 2,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pard3Q99NH2 1333 aa30,22■■■□□ 2,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 CatipB9EKE5 520 aa30,21■■■□□ 2,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zbtb4Q5F293 982 aa30,21■■■□□ 2,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gimap6Q8K349 305 aa30,21■■■□□ 2,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mast2Q60592 1734 aa30,21■■■□□ 2,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ubap1lG3UW59 384 aa30,2■■■□□ 2,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 OscarQ8VBT3 265 aa30,2■■■□□ 2,43
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Map3k19E9Q3S4 1311 aa30,19■■■□□ 2,42
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm21698A0A087WQP8 267 aa30,18■■■□□ 2,42
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm21671G3UY31 267 aa30,18■■■□□ 2,42
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 FanciQ8K368 1330 aa30,17■■■□□ 2,42
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pm20d1Q8C165 503 aa30,15■■■□□ 2,42
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP30,15■■■□□ 2,42
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ncoa4Q5U4H9 625 aa30,12■■■□□ 2,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Slx1bQ8BX32 270 aa30,12■■■□□ 2,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Taok3Q8BYC6 898 aa30,11■■■□□ 2,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 TonslQ6NZL6 1363 aa30,11■■■□□ 2,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zeb2Q9R0G7 1215 aa30,1■■■□□ 2,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Znf335A2A5K6 1337 aa30,1■■■□□ 2,41
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa30,07■■■□□ 2,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Akap11E9Q777 1895 aa30,07■■■□□ 2,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Card10P58660 1021 aa30,02■■■□□ 2,4
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 InsrP15208 1372 aa30■■■□□ 2,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa29,98■■■□□ 2,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rundc1Q0VDN7 615 aa29,98■■■□□ 2,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa29,97■■■□□ 2,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Amotl2Q8K371 772 aa29,97■■■□□ 2,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP29,96■■■□□ 2,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kif16bB1AVY7 1312 aa29,96■■■□□ 2,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rock2P70336 1388 aa29,95■■■□□ 2,39
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nwd2Q6P5U7 1742 aa29,93■■■□□ 2,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Kcnh5Q920E3 988 aa29,93■■■□□ 2,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cnga1P29974 684 aa29,92■■■□□ 2,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dennd6aQ8BH65 605 aa29,92■■■□□ 2,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Apba2P98084 750 aa29,91■■■□□ 2,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Dnajc10Q9DC23 793 aa29,91■■■□□ 2,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nlgn1Q99K10 843 aa29,9■■■□□ 2,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 TnrQ8BYI9 1358 aa29,9■■■□□ 2,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa29,89■■■□□ 2,38
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Fmnl2A2APV2 1086 aa29,84■■■□□ 2,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Vps33bP59016 617 aa29,84■■■□□ 2,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 RgmbQ7TQ33 436 aa29,84■■■□□ 2,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Mdc1Q5PSV9 1707 aa29,83■■■□□ 2,37
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 TatQ8QZR1 454 aa29,82■■■□□ 2,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cabp4Q8VHC5 271 aa29,82■■■□□ 2,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 GakQ99KY4 1305 aa29,8■■■□□ 2,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ankrd23Q812A3 306 aa29,8■■■□□ 2,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP29,79■■■□□ 2,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ubr1O70481 1757 aa29,78■■■□□ 2,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 GalcP54818 684 aa29,77■■■□□ 2,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ezh2Q61188 746 aaKnown RBP29,77■■■□□ 2,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP29,77■■■□□ 2,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Astn2Q80Z10 1352 aa29,77■■■□□ 2,36
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Map2P20357 1828 aa29,75■■■□□ 2,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP29,75■■■□□ 2,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Lrit1Q8K099 624 aa29,75■■■□□ 2,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa29,74■■■□□ 2,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP29,74■■■□□ 2,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Pak3Q61036 559 aa29,73■■■□□ 2,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa29,73■■■□□ 2,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Vars2Q3U2A8 1060 aa29,71■■■□□ 2,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ano8Q6PB70 1060 aa29,71■■■□□ 2,35
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 FancaQ9JL70 1439 aa29,7■■■□□ 2,34
Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 Ginm1Q91WR6 327 aa29,69■■■□□ 2,34
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