RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000122421.1

Ccsap-202, Transcript of Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccsap, Length 2,673 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cfap65Q3V0B4 1847 aa28.45■■■□□ 2.15
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Antxr1Q9CZ52 562 aa28.45■■■□□ 2.14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Kiaa0556Q8C753 1610 aa28.45■■■□□ 2.14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 CastP51125 788 aa28.42■■■□□ 2.14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa28.42■■■□□ 2.14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Atp10aO54827 1508 aa28.4■■■□□ 2.14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 AU015836B2RUM3 263 aa28.39■■■□□ 2.14
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cavin4A2AMM0 362 aa28.38■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Mroh1E0CZ22 1640 aa28.38■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 AU019823E9PUQ3 292 aa28.37■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa28.37■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 PtprtQ99M80 1454 aa28.37■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa28.36■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ankrd50F7BE84 1390 aa28.35■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ccdc60Q8C4J0 545 aa28.35■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Kif18aQ91WD7 886 aa28.34■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 PaskQ8CEE6 1383 aa28.34■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Catsper2A2ARP9 588 aa28.34■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Pdcl3Q8BVF2 240 aa28.34■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa28.33■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Terf2O35144 541 aa28.33■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 SkilQ60665 675 aa28.33■■■□□ 2.13
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Kif2cQ922S8 721 aa28.32■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Znf541Q0GGX2 1363 aa28.32■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Spryd3E9Q9B3 442 aa28.3■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Stk26Q99JT2 416 aa28.3■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 FanciQ8K368 1330 aa28.3■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Znf330Q922H9 316 aa28.29■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Phf14Q9D4H9 881 aa28.29■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ptch1Q61115 1434 aa28.29■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Knl1Q66JQ7 1612 aa28.27■■■□□ 2.12
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Mcm4P49717 862 aa28.26■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa28.25■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Zranb1Q7M760 708 aa28.25■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cog6Q8R3I3 657 aa28.25■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Pik3r4Q8VD65 1358 aa28.24■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ssh1Q76I79 1042 aa28.24■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 AglF8VPN4 1532 aa28.23■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Swt1Q9DBQ9 907 aa28.23■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Kif20aP97329 887 aa28.23■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gsto1O09131 240 aa28.22■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Fchsd2Q3USJ8 740 aa28.22■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Kcnn1Q9EQR3 537 aa28.22■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Wwc1Q5SXA9 1104 aa28.2■■■□□ 2.11
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Usp32F8VPZ3 1604 aa28.2■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Atp1b4Q99ME6 356 aa28.2■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gm10093D3YYI8 482 aa28.18■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Gtf2a1Q99PM3 378 aa28.18■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 AdgbG3UZ78 1657 aa28.18■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Adamts7Q68SA9 1657 aa28.17■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 NinlQ6ZQ12 1394 aa28.17■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Shq1Q7TMX5 569 aa28.17■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Atp7bQ64446 1462 aa28.17■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cetn4Q8K4K1 168 aa28.16■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Naip7Q9JIB3 1402 aa28.16■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Nutm1Q8BHP2 1126 aa28.16■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa28.16■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Slc12a5Q91V14 1138 aa28.16■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Q4VA45 678 aa28.15■■■□□ 2.1
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa28.14■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rsph3aQ3UFY4 516 aa28.14■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa28.14■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Tmco5bQ80X59 307 aa28.14■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 MvpQ9EQK5 861 aa28.13■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 PalmQ9Z0P4 383 aa28.13■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Plcb2A3KGF7 1181 aa28.13■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Dip2cE9PWR4 1557 aa28.12■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 RereQ80TZ9 1558 aa28.12■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cep170bQ80U49 1574 aa28.12■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Q3UPC7 1272 aa28.11■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Nectin2P32507 530 aa28.11■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Nsd3Q6P2L6 1439 aa28.1■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Trim28Q62318 834 aa28.1■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cdk19Q8BWD8 501 aa28.1■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 LifrP42703 1092 aa28.1■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa28.09■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa28.09■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Rfx1P48377 963 aa28.08■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Wdr63B2RY71 923 aa28.08■■■□□ 2.09
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Arhgef28P97433 1693 aa28.07■■■□□ 2.08
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ankrd44B2RXR6 993 aa28.07■■■□□ 2.08
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Vamp4O70480 141 aa28.07■■■□□ 2.08
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Ddit3P35639 168 aa28.06■■■□□ 2.08
Ccsap-202ENSMUST00000122421 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
Ccsap-202ENSMUST00000122421 PtprmP28828 1452 aa28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.9 ms