RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000062829.8

Hoxa6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa6, Length 874 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Abca15E9PWH4 1668 aa23.79■■□□□ 1.4
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Znf335A2A5K6 1337 aa23.79■■□□□ 1.4
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Card11Q8CIS0 1159 aa23.78■■□□□ 1.4
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gimap6Q8K349 305 aa23.78■■□□□ 1.4
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Psrc1Q9D0P7 329 aa23.76■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Col16a1Q8BLX7 1580 aa23.76■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 MpndQ3TV65 487 aa23.75■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rtl5Q5DTT4 599 aa23.75■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Map3k19E9Q3S4 1311 aa23.75■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zbtb4Q5F293 982 aa23.74■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sbno1Q689Z5 1390 aa23.74■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rock2P70336 1388 aa23.73■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Dzip1Q8BMD2 852 aa23.72■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 InsrP15208 1372 aa23.72■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Bcl9lQ67FY2 1494 aa23.71■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 PaskQ8CEE6 1383 aa23.71■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ncoa4Q5U4H9 625 aa23.71■■□□□ 1.39
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nfat5Q9WV30 1534 aa23.7■■□□□ 1.38
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa23.7■■□□□ 1.38
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Txnrd1Q9JMH6 613 aa23.7■■□□□ 1.38
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rgs17Q9QZB0 210 aa23.7■■□□□ 1.38
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Shank2Q80Z38 1476 aa23.68■■□□□ 1.38
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa23.67■■□□□ 1.38
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pola1P33609 1465 aa23.67■■□□□ 1.38
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Col22a1E9Q7P1 1613 aa23.66■■□□□ 1.38
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 TonslQ6NZL6 1363 aa23.65■■□□□ 1.38
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nid2O88322 1403 aa23.63■■□□□ 1.37
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa23.62■■□□□ 1.37
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Slx1bQ8BX32 270 aa23.6■■□□□ 1.37
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pard3Q99NH2 1333 aa23.59■■□□□ 1.37
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm21698A0A087WQP8 267 aa23.59■■□□□ 1.37
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm21671G3UY31 267 aa23.59■■□□□ 1.37
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zeb2Q9R0G7 1215 aa23.59■■□□□ 1.37
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccdc129Q14B48 1034 aa23.58■■□□□ 1.37
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Card10P58660 1021 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pm20d1Q8C165 503 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kcnh5Q920E3 988 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tet3Q8BG87 1668 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kif16bB1AVY7 1312 aa23.55■■□□□ 1.36
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cnga1P29974 684 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Dennd6aQ8BH65 605 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ccdc6D3YZP9 469 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nlgn1Q99K10 843 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ltbp1Q8CG19 1712 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Amotl2Q8K371 772 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tnks1bp1P58871 1720 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cacna1sQ02789 1880 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Astn2Q80Z10 1352 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fmnl2A2APV2 1086 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ano8Q6PB70 1060 aa23.45■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Sugp2Q8CH09 1067 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cabp4Q8VHC5 271 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Dnajc10Q9DC23 793 aa23.43■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fer1l6E0CZ42 1862 aa23.43■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 TatQ8QZR1 454 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 CemipQ8BI06 1361 aa23.4■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 TnrQ8BYI9 1358 aa23.4■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa23.4■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa23.4■■□□□ 1.34
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Vps33bP59016 617 aa23.39■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa23.38■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 NefmP08553 848 aa23.38■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Taok3Q8BYC6 898 aa23.38■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.38■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa23.38■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa23.36■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kat6bQ8BRB7 1872 aa23.36■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ly75Q60767 1723 aa23.34■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ildr2B5TVM2 661 aa23.34■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 RgmbQ7TQ33 436 aa23.34■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 OscarQ8VBT3 265 aa23.34■■□□□ 1.33
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Slc4a1apE9PX68 744 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Plekhd1B2RPU2 505 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mast2Q60592 1734 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ankrd23Q812A3 306 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ginm1Q91WR6 327 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mdc1Q5PSV9 1707 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ubr1O70481 1757 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 CrklP47941 303 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fam184bQ0KK56 942 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 OptnQ8K3K8 584 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Akap11E9Q777 1895 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pak3Q61036 559 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rad17Q6NXW6 688 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Slc24a1Q91WD8 1130 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ubap1lG3UW59 384 aa23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.8 ms