RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060125.6

Scn4b-201, Transcript of Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4b, Length 4,982 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hnrnpul1Q8VDM6 859 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Paf1Q8K2T8 535 aa16.61■□□□□ 0.25
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pde4cQ3UEI1 686 aa16.61■□□□□ 0.25
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fancd2Q80V62 1450 aa16.6■□□□□ 0.25
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa16.6■□□□□ 0.25
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rsph6aQ8CDR2 708 aa16.6■□□□□ 0.25
Scn4b-201ENSMUST00000060125 NefhP19246 1090 aa16.6■□□□□ 0.25
Scn4b-201ENSMUST00000060125 AcrbpQ3V140 540 aa16.6■□□□□ 0.25
Scn4b-201ENSMUST00000060125 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Triml2E9PW10 424 aa16.59■□□□□ 0.25
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tnnt1O88346 262 aa16.59■□□□□ 0.25
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Camsap2Q8C1B1 1461 aa16.59■□□□□ 0.25
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Bag1Q60739 355 aa16.58■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Med4Q9CQA5 270 aa16.58■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cfap99A0A140LIX9 648 aa16.58■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cavin1O54724 392 aa16.58■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sycp1Q62209 993 aa16.58■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Znf526Q8BI66 675 aa16.58■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MicalclQ9D5U9 680 aa16.58■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nol12Q8BG17 217 aa16.57■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Chmp3Q9CQ10 224 aa16.57■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tceal9Q9DD24 104 aa16.57■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Usp48Q3V0C5 1052 aa16.57■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Phldb2Q8K1N2 1249 aa16.57■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm42641I6L9G2 585 aa16.57■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 AtripQ8BMG1 785 aa16.57■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ubap1lG3UW59 384 aa16.56■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 ImpactO55091 318 aa16.56■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Stk31Q99MW1 1018 aa16.56■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa16.56■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Abca5Q8K448 1642 aa16.56■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Krt82Q99M74 516 aa16.56■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ttll5Q8CHB8 1328 aa16.56■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hvcn1Q3U2S8 269 aa16.55■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Unc13aQ4KUS2 1712 aa16.55■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Erc2Q6PH08 957 aa16.55■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 TnmdQ9EP64 317 aa16.55■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Jakmip2D3YXK0 820 aa16.55■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pibf1E9Q6K3 756 aa16.54■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa16.54■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zkscan2G3X952 960 aa16.54■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 BC005561E9Q5E2 1589 aa16.54■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kcnj4P52189 445 aa16.54■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Magi3Q9EQJ9 1476 aa16.54■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Shroom2A2ALU4 1481 aa16.53■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa16.53■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 ItpripQ3TNL8 555 aa16.52■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gbp4Q61107 620 aa16.52■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rcan3Q9JKK0 239 aa16.52■□□□□ 0.24
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa16.52■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zfp644E9QA22 1323 aa16.52■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Paxbp1P58501 919 aa16.52■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Frmd3Q8BHD4 595 aa16.52■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Stk26Q99JT2 416 aa16.52■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 NexnQ7TPW1 607 aa16.51■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dydc1Q9D9T0 175 aa16.51■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hoxa7P02830 229 aa16.51■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Plekhg5Q66T02 1073 aa16.51■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tubb6Q922F4 447 aa16.51■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zhx1P70121 873 aa16.51■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gcc1Q9D4H2 778 aa16.51■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Syce3B5KM66 88 aa16.51■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sass6Q80UK7 654 aa16.51■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 PxdnQ3UQ28 1475 aa16.51■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kiaa0753Q6A000 959 aa16.5■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ncoa3O09000 1398 aa16.5■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hmox1P14901 289 aa16.5■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ric3Q8BPM6 367 aa16.5■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa16.5■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trim30cD3YVI9 513 aa16.49■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa16.49■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gnai1B2RSH2 354 aa16.49■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ppp1r9bQ6R891 817 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gnai3Q9DC51 354 aa16.49■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Erlin2Q8BFZ9 340 aa16.49■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fan1Q69ZT1 1020 aa16.48■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CenpqQ9CPQ5 267 aa16.48■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa16.48■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 TxlnbQ8VBT1 685 aa16.48■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 NmiO35309 314 aa16.48■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem132aQ922P8 1018 aa16.48■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Psme1P97371 249 aa16.48■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 LarsQ8BMJ2 1178 aa16.48■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Asxl1P59598 1514 aa16.48■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pik3c2gO70167 1506 aa16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 73.4 ms