RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047362.10

Rccd1-201, Transcript of RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rccd1, Length 3,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1-201ENSMUST00000047362 IqubQ8CDK3 788 aa16.04■□□□□ 0.16
Rccd1-201ENSMUST00000047362 KdrP35918 1367 aa16.04■□□□□ 0.16
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Rfx1P48377 963 aa16.04■□□□□ 0.16
Rccd1-201ENSMUST00000047362 DnmbpQ6TXD4 1580 aa16.04■□□□□ 0.16
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa16.04■□□□□ 0.16
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Stk26Q99JT2 416 aa16.04■□□□□ 0.16
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Antxr1Q9CZ52 562 aa16.04■□□□□ 0.16
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Catsper2A2ARP9 588 aa16.03■□□□□ 0.16
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa16.03■□□□□ 0.16
Rccd1-201ENSMUST00000047362 CatipB9EKE5 520 aa16.02■□□□□ 0.16
Rccd1-201ENSMUST00000047362 InsrP15208 1372 aa16.02■□□□□ 0.16
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Phlpp2Q8BXA7 1320 aa16.02■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Uggt1Q6P5E4 1551 aa16.02■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Prex1Q69ZK0 1650 aa16.01■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Mcm4P49717 862 aa16.01■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Abca9Q8K449 1623 aa16.01■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Nectin2P32507 530 aa16.01■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Kif2cQ922S8 721 aa16.01■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Nutm1Q8BHP2 1126 aa16■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 CenpjQ569L8 1344 aa16■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 PalldQ9ET54 1408 aa16■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 CastP51125 788 aa15.99■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ccdc60Q8C4J0 545 aa15.99■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa15.99■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa15.99■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Lrrc7Q80TE7 1490 aa15.98■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Aplp1Q03157 653 aa15.98■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Kif18aQ91WD7 886 aa15.97■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Cog6Q8R3I3 657 aa15.97■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Skint5A7XUY5 1461 aa15.97■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Terf2O35144 541 aa15.96■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Atp1b4Q99ME6 356 aa15.96■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Tnnt2P50752 301 aa15.96■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Q4VA45 678 aa15.96■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Hfm1D3Z4R1 1434 aa15.96■□□□□ 0.15
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Trpm1Q2TV84 1622 aa15.96■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Fbxo2Q80UW2 297 aa15.95■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Map7O88735 730 aa15.94■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Adgrl3Q80TS3 1537 aa15.94■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Adgrl1Q80TR1 1466 aa15.94■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 MaddQ80U28 1577 aa15.94■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 PtmaP26350 111 aa15.93■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Kif20aP97329 887 aa15.93■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Tmco5bQ80X59 307 aa15.93■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Cavin4A2AMM0 362 aa15.93■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 SkilQ60665 675 aa15.92■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Slc52a2Q9D8F3 450 aa15.92■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ankrd50F7BE84 1390 aa15.92■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ttc37F8VPK0 1563 aa15.92■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa15.91■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Kiaa0556Q8C753 1610 aa15.9■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Cers3Q1A3B0 383 aa15.9■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa15.9■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa15.9■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ptch1Q61115 1434 aa15.9■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Gli2Q0VGT2 1544 aa15.9■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Hs1bp3Q3TC93 395 aa15.9■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 GorabQ8BRM2 368 aa15.9■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 PtprtQ99M80 1454 aa15.9■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Cfap65Q3V0B4 1847 aa15.9■□□□□ 0.14
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 VgfQ0VGU4 617 aa15.89■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Slc12a5Q91V14 1138 aa15.89■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 OvosQ3UU35 1456 aa15.88■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Shq1Q7TMX5 569 aa15.88■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Hecw2Q6I6G8 1578 aa15.88■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa15.88■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Nrxn1Q9CS84 1514 aa15.88■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa15.87■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ino80Q6ZPV2 1559 aa15.87■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ddrgk1Q80WW9 315 aa15.87■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 PalmQ9Z0P4 383 aa15.87■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Tecpr2Q3UH45 1423 aa15.86■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ddit3P35639 168 aa15.86■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Depdc5P61460 1591 aa15.86■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 NinlQ6ZQ12 1394 aa15.85■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Q3UPC7 1272 aa15.85■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa15.85■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 BccipQ9CWI3 316 aa15.85■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Swt1Q9DBQ9 907 aa15.85■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 FanciQ8K368 1330 aa15.85■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa15.85■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Erbb4Q61527 1308 aa15.85■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa15.84■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ift172Q6VH22 1749 aa15.84■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Gsto1O09131 240 aa15.84■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Ripk4Q9ERK0 786 aa15.84■□□□□ 0.13
Rccd1-201ENSMUST00000047362 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.2 ms