RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D3EA0A087X179 549 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D3LB9A6J9 549 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 LTFP02788 710 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D3HP0C7X1 549 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 GOT1P17174 413 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ADPRHP54922 357 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC173Q0VFZ6 552 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 LRMPQ12912 555 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CBWD6Q4V339 395 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CBWD3Q5JTY5 395 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CBWD5Q5RIA9 395 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP52Q8N1V2 620 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SCML4Q8N228 414 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 STK40Q8N2I9 435 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 AADATQ8N5Z0 425 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM1BQ8NB78 822 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 IRGQQ8WZA9 623 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TSC1Q92574 1164 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 MYEOVQ96EZ4 313 aa28.34■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 BRINP1O60477 761 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ADH1BP00325 375 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 IL1BP01584 269 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 GLDCP23378 1020 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 DPYDQ12882 1025 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 EDRF1Q3B7T1 1238 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ZCWPW2Q504Y3 356 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 FSCBQ5H9T9 825 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR155Q7Z3F1 870 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF605Q86T29 641 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 FGF11Q92914 225 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 HPSEQ9Y251 543 aa28.33■■■□□ 2.13
CAPNS1-217ENST00000629983 PLXNA2O75051 1894 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 M0QYV0 167 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 CKMT2P17540 419 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 C5AR1P21730 350 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTN2P35609 894 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP2CBP62714 309 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP2CAP67775 309 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 ECT2LQ008S8 904 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 ILKQ13418 452 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC4CQ8WTT0 213 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 AZIN2Q96A70 460 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 MIS12Q9H081 205 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1257Q9ULG3 409 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 CLCA2Q9UQC9 943 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 BPTFQ12830 3046 aa28.32■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA2G2AP14555 144 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 CXADRP78310 365 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 PKP1Q13835 747 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 ARID5BQ14865 1188 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 PMF1Q6P1K2 205 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 LCLAT1Q6UWP7 414 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINB11Q96P15 392 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM129BQ96TA1 746 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 SDC3O75056 442 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 NNMTP40261 264 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 RXRGP48443 463 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 NUMBP49757 651 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA8P51970 172 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF6Q58WW2 860 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 MS4A13Q5J8X5 152 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 SFMBT2Q5VUG0 894 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM270Q6UE05 265 aa28.3■■■□□ 2.12
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CAPNS1-217ENST00000629983 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA32Q96LK8 384 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 KNTC1P50748 2209 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 ITIH6Q6UXX5 1313 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 STK19P49842 368 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 NUCB2P80303 420 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 PKDCCQ504Y2 493 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM7AQ6ZMT4 941 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 LGI2Q8N0V4 545 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD2AQ8NA29 543 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-217ENST00000629983 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
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