RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620722.4

CACNA2D3-212, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-212ENST00000620722 CD247P20963 164 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 SNAP25P60880 206 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 ATP6V0D1P61421 351 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 C16orf87Q6PH81 154 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 WDTC1Q8N5D0 677 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 MAPK15Q8TD08 544 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 ATP2A3Q93084 1043 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 FEM1CQ96JP0 617 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 CCDC138Q96M89 665 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 ARMC7Q9H6L4 198 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 SEPT3Q9UH03 358 aa7.16□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 DYTNA2CJ06 578 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 CFAP99D6REC4 459 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 TPP1O14773 563 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 PFDN6O15212 129 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 P4HA1P13674 534 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 MX2P20592 715 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 TMBIM6P55061 237 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 CDH15P55291 814 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 GTF2IP78347 998 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 CAMK2BQ13554 666 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 NR1D2Q14995 579 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 NRF1Q16656 503 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 RFX6Q8HWS3 928 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 RCN3Q96D15 328 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 C8orf37Q96NL8 207 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 OR52B2Q96RD2 323 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC29A1Q99808 456 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 C1orf50Q9BV19 199 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 C8orf4Q9NR00 106 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.15□□□□□ -1.26
CACNA2D3-212ENST00000620722 A0A1W2PPW3 197 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 TRIM24O15164 1050 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 KLHL41O60662 606 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 VAPBO95292 243 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 ALOX5P09917 674 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 CD1EP15812 388 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 JAK1P23458 1154 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 PSMA2P25787 234 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 NFKBIAP25963 317 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 NRLP54845 237 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 PTPRJQ12913 1337 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 NFATC3Q12968 1075 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZBTB17Q13105 803 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 SEPT6Q14141 434 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 RAB39AQ14964 217 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 FGD3Q5JSP0 725 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 PPM1LQ5SGD2 360 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 XKR5Q6UX68 686 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 TMEM179Q6ZVK1 233 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC51AQ86UW1 340 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 SLC15A4Q8N697 577 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 LRTOMTQ8WZ04 291 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 ADGRA2Q96PE1 1338 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 ADAMTS10Q9H324 1103 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 ZBTB26Q9HCK0 441 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 MTMR10Q9NXD2 777 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 KLHL3Q9UH77 587 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 CPQQ9Y646 472 aa7.15□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 GIPC1O14908 333 aa7.14□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 SPTLC1O15269 473 aa7.14□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CACNA2D3-212ENST00000620722 ATG7O95352 703 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms