RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	ERBB2	P04626	1255 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDGFRA	P16234	1089 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	MAOB	P27338	520 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	SULT1E1	P49888	294 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	DEUP1	Q05D60	604 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTPRN	Q16849	979 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACCSL	Q4AC99	568 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP30	Q70CQ3	517 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF677	Q86XU0	584 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	SIK2	Q9H0K1	926 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	MUC3B	Q9H195	1237 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD93	Q9NPY3	652 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CACNA1A	O00555	2505 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197		F8VZ95	297 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLDN11	O75508	207 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	FSBP	O95073	299 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADH1B	P00325	375 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF18	P17022	549 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	DES	P17661	470 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	SCNN1A	P37088	669 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	STAT1	P42224	750 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRT83	P78385	493 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	MYL5	Q02045	173 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	FOXC1	Q12948	553 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC14A1	Q13336	389 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRT31	Q15323	416 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CST6	Q15828	149 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	FSCB	Q5H9T9	825 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	NEK11	Q8NG66	645 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	VPS28	Q9UK41	221 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	DMD	P11532	3685 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	THADA	Q6YHU6	1953 aa		11.3	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKRD62	A6NC57	917 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	SIN3B	O75182	1162 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	PAGE1	O75459	146 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	GFPT2	O94808	682 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	IL1B	P01584	269 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC172	P0C7W6	258 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	C5AR1	P21730	350 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	PML	P29590	882 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACSL1	P33121	698 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	PSMD8	P48556	350 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDH4	P55283	916 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	C21orf59	P57076	290 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	GRIK2	Q13002	908 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	SEMA3B	Q13214	749 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	NAA35	Q5VZE5	725 aa		11.29	□□□□□ -0.6
NPIPB4-222	ENST00000614197	FBXL22	Q6P050	247 aa		11.29	□□□□□ -0.6

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