RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 SIK2Q9H0K1 926 aa20.52■□□□□ 0.88
EFTUD2-217ENST00000590124 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.52■□□□□ 0.88
EFTUD2-217ENST00000590124 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF217O75362 1048 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 TNFAIP3P21580 790 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 PLK1P53350 603 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ATP11AP98196 1134 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM131BQ86XD5 332 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 MCOLN2Q8IZK6 566 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF366Q8N895 744 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 HAPLN3Q96S86 360 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 NUP58Q9BVL2 599 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 CD93Q9NPY3 652 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 TAS2R14Q9NYV8 317 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 USP18Q9UMW8 372 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.51■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 NUP205Q92621 2012 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A1W2PQJ5 194 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 DRGXA6NNA5 263 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SDC4P31431 198 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 MPLP40238 635 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 STRADAQ7RTN6 431 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 KDM1BQ8NB78 822 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ALG14Q96F25 216 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 IFNKQ9P0W0 207 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.5■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 DOCK4Q8N1I0 1966 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 MAP3K13O43283 966 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 CLDN11O75508 207 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 CNTN5O94779 1100 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 MOCS3O95396 460 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF806P0C7X5 589 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 CDH4P55283 916 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 OXCT1P55809 520 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 LMNB2Q03252 620 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ARID5BQ14865 1188 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC6Q16204 474 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 CDO1Q16878 200 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ALFQ53S48 1182 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 WDR59Q6PJI9 974 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEFF1Q8IYR6 380 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 OR2T3Q8NH03 318 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ITM2CQ9NQX7 267 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 CYP8B1Q9UNU6 501 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.49■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 IGLV3-19P01714 112 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 GPD1P21695 349 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 RRM1P23921 792 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 HDAC4P56524 1084 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ECT2LQ008S8 904 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 CREB5Q02930 508 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 KLHL30Q0D2K2 578 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 NFKBIBQ15653 356 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 DNAJC24Q6P3W2 148 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 FBRSQ9HAH7 460 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 SUN2Q9UH99 717 aa20.48■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 DMXL1Q9Y485 3027 aa20.47■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 E9PAM4 449 aa20.47■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
EFTUD2-217ENST00000590124 GZMAP12544 262 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms