RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 CD19P15391 556 aa12.07□□□□□ -0.48
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CAPNS1-209ENST00000590049 IGF2-ASQ6U949 168 aa12.07□□□□□ -0.48
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CAPNS1-209ENST00000590049 CEP83Q9Y592 693 aa12.06□□□□□ -0.48
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR4Q2P0C623 313 aa12.05□□□□□ -0.48
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CAPNS1-209ENST00000590049 ANXA13P27216 316 aa12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-209ENST00000590049 GRIA4P48058 902 aa12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC6A11P48066 632 aa12.05□□□□□ -0.48
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CAPNS1-209ENST00000590049 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa12.05□□□□□ -0.48
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CAPNS1-209ENST00000590049 TXLNBQ8N3L3 684 aa12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-209ENST00000590049 EID2Q8N6I1 236 aa12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-209ENST00000590049 UBR7Q8N806 425 aa12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-209ENST00000590049 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-209ENST00000590049 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-209ENST00000590049 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-209ENST00000590049 WDR70Q9NW82 654 aa12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-209ENST00000590049 CNTN6Q9UQ52 1028 aa12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-209ENST00000590049 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
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