RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 MAPKAPK2P49137 400 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 NDST2P52849 883 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM217AQ8IXS0 508 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 LGI2Q8N0V4 545 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 USP29Q9HBJ7 922 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 MPP6Q9NZW5 540 aa31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 MTSS1O43312 755 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 GREM1O60565 184 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 TCF3P15923 654 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 WEE1P30291 646 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 HYAL1Q12794 435 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 STXBP5Q5T5C0 1151 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 IGSF8Q969P0 613 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC45Q96CN5 670 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 SNF8Q96H20 258 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDM12Q9H4Q4 367 aa31.89■■■□□ 2.7
CAPNS1-206ENST00000588815 ESYT3A0FGR9 886 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNB1P01574 187 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ITIH2P19823 946 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 RBL1P28749 1068 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC6A4P31645 630 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM10P98175 930 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 P3H1Q32P28 736 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TCEAL5Q5H9L2 206 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 AFMIDQ63HM1 303 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM31Q9BZY9 425 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 DPH5Q9H2P9 285 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 IGFLR1Q9H665 355 aa31.88■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNN4O15554 427 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K6O95382 1288 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
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CAPNS1-206ENST00000588815 RPL21P46778 160 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CARSP49589 748 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH4P55283 916 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 NTHL1P78549 312 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ZXDBP98169 803 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CAV1Q03135 178 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CALCOCO2Q13137 446 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TMC5Q6UXY8 1006 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CHST9Q7L1S5 443 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CPXM2Q8N436 756 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM71DQ8N9W8 422 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 HTR3CQ8WXA8 447 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 IFT81Q8WYA0 676 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX24Q9Y343 169 aa31.87■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 E2F8A0AVK6 867 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 STK10O94804 968 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 IVDP26440 423 aa31.86■■■□□ 2.69
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CAPNS1-206ENST00000588815 ADCY8P40145 1251 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GDF10P55107 478 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR149Q86SP6 731 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA1958Q8N8K9 716 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 WBP2Q969T9 261 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TSGA13Q96PP4 275 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 HINFPQ9BQA5 517 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TDP1Q9NUW8 608 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 PAK5Q9P286 719 aa31.86■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CFAP97Q9P2B7 532 aa31.86■■■□□ 2.69
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CAPNS1-206ENST00000588815 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
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CAPNS1-206ENST00000588815 LEFTY2O00292 366 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CLDN11O75508 207 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GLP2RO95838 553 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
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CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD54Q6NXT1 300 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 PCGF5Q86SE9 256 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNYQ8ND76 341 aa31.85■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
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CAPNS1-206ENST00000588815 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 AP1B1Q10567 949 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 RFWD3Q6PCD5 774 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 LGMNQ99538 433 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 KIF9Q9HAQ2 790 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GRHL1Q9NZI5 618 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 LAMA3Q16787 3333 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GVM2 712 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 TCAF2A6NFQ2 919 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTN5O94779 1100 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNCP24863 283 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 EMBQ6PCB8 327 aa31.84■■■□□ 2.69
CAPNS1-206ENST00000588815 GLIS1Q8NBF1 620 aa31.84■■■□□ 2.69
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