RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 PSMD5Q16401 504 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 CDO1Q16878 200 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 UROC1Q96N76 676 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 SMC6Q96SB8 1091 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 KLC2Q9H0B6 622 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNK12Q9HB15 430 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXW11Q9UKB1 542 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAM12O43184 909 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX3O60493 162 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 GRAP2O75791 330 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM155BO75949 473 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM63AO94886 807 aa26.2■■□□□ 1.78
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZBED1O96006 694 aa26.2■■□□□ 1.78
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CAPNS1-204ENST00000587718 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 PALM2Q8IXS6 379 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 C3orf58Q8NDZ4 430 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 TRABDQ9H4I3 376 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 CCT8L1PA6NM43 557 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 GCATO75600 419 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A52Q3SY17 297 aa26.19■■□□□ 1.78
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CAPNS1-204ENST00000587718 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
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CAPNS1-204ENST00000587718 DENND1AQ8TEH3 1009 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 CCT6BQ92526 530 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 CYTH2Q99418 400 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 PRRX2Q99811 253 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 KMT2EQ8IZD2 1858 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC130P13994 396 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP2F1P24903 491 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ADORA2BP29275 332 aa26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC45A4Q5BKX6 768 aa26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC2A14Q8TDB8 520 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 NT5C3BQ969T7 300 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 MYADMQ96S97 322 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 IGSF9Q9P2J2 1179 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 EPS15L1Q9UBC2 864 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 AP4E1Q9UPM8 1137 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-204ENST00000587718 CREB1P16220 341 aa26.17■■□□□ 1.78
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CAPNS1-204ENST00000587718 MPP2Q14168 576 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 TPSAB1Q15661 275 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 NPNTQ6UXI9 565 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa26.17■■□□□ 1.78
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CAPNS1-204ENST00000587718 TBK1Q9UHD2 729 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 STAP1Q9ULZ2 295 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 TEX264Q9Y6I9 313 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ZWINTO95229 277 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ASMTLO95671 621 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT15P19012 456 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 IFNAR2P48551 515 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 OSTM1Q86WC4 334 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 B3GNT5Q9BYG0 378 aa26.16■■□□□ 1.78
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CAPNS1-204ENST00000587718 RRN3Q9NYV6 651 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 VWA8A3KMH1 1905 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 TCP11X1B4DZS4 312 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 CYB561D2O14569 222 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNN4O15554 427 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 BRCC3P46736 316 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK16Q00536 496 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 BBS9Q3SYG4 887 aa26.16■■□□□ 1.78
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CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf228Q6PIY5 440 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 PIGZQ86VD9 579 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 FUKQ8N0W3 1084 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD42Q8N9B4 389 aa26.16■■□□□ 1.78
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