RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ITGB1P05556 798 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 MYBL1P10243 752 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ARP10275 920 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 KRT4P19013 534 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 CHRNA5P30532 468 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 YWHABP31946 246 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 MAN1A1P33908 653 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 CETN2P41208 172 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 CASP5P51878 434 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 AP3M2P53677 418 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 GALCP54803 685 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 NRG3P56975 720 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 PHC1P78364 1004 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 MYL7Q01449 175 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 GUCY2DQ02846 1103 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 C2orf54Q08AI8 447 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 COG2Q14746 738 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ARHGEF16Q5VV41 709 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 KRT39Q6A163 491 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 C11orf63Q6NUN7 778 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ARMC9Q7Z3E5 817 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 HAUS6Q7Z4H7 955 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF575Q86XF7 245 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF677Q86XU0 584 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 IQCKQ8N0W5 287 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 PPM1KQ8N3J5 372 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 LRRC57Q8N9N7 239 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 CYP2W1Q8TAV3 490 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ACER1Q8TDN7 264 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 HES6Q96HZ4 224 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 CAMKK2Q96RR4 588 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 RMDN3Q96TC7 470 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 AGPAT1Q99943 283 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 SH3GL2Q99962 352 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ENKD1Q9H0I2 346 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 FAM204AQ9H8W3 233 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 MYOZ2Q9NPC6 264 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 SIX2Q9NPC8 291 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ING3Q9NXR8 418 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 UVRAGQ9P2Y5 699 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 FBXO40Q9UH90 709 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 GGA2Q9UJY4 613 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 NENFQ9UMX5 172 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 SORCS3Q9UPU3 1222 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 COQ4Q9Y3A0 265 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ZHX2Q9Y6X8 837 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 SIPA1L1O43166 1804 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 CNTNAP1P78357 1384 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 SCN9AQ15858 1988 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 CLRN2A0PK11 232 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF233A6NK53 670 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 RSPH10B2B2RC85 870 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 H3BQF6 201 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 K7ENM7 598 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 EBAG9O00559 213 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 WNT10BO00744 389 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ZEB2O60315 1214 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 STC2O76061 302 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ABHD16AO95870 558 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 PFKMP08237 780 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 RSPH10BP0C881 870 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 MYZAPP0CAP1 466 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 TGFB3P10600 412 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ACTN1P12814 892 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 ALAS1P13196 640 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 HK1P19367 917 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 CNGA1P29973 690 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 NMT1P30419 496 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 CHRNA3P32297 505 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 COPB2P35606 906 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 SLC1A1P43005 524 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRM-215ENST00000583289 CASP4P49662 377 aa4.8□□□□□ -1.64
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