RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	PWWP2A	Q96N64	755 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	HAPLN3	Q96S86	360 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	KLC4	Q9NSK0	619 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	COMMD8	Q9NX08	183 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	HES2	Q9Y543	173 aa		12.14	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	ARL5C	A6NH57	179 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	COPE	O14579	308 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	MGRN1	O60291	552 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	BAIAP3	O94812	1187 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	LTF	P02788	710 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	PGAM1	P18669	254 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	IRS1	P35568	1242 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	CCNF	P41002	786 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	CXCR3	P49682	368 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	TCF15	Q12870	199 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	TUSC3	Q13454	348 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	DPYS	Q14117	519 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	LRRC14	Q15048	493 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	MSS51	Q4VC12	460 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	WSCD1	Q658N2	575 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	RFX8	Q6ZV50	586 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC63	Q8NA47	563 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	HDAC11	Q96DB2	347 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	TSGA13	Q96PP4	275 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	APOL6	Q9BWW8	343 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	RNF39	Q9H2S5	420 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	MID2	Q9UJV3	735 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	NME7	Q9Y5B8	376 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM186A	A6NE01	2351 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	SCN1A	P35498	2009 aa		12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	PTPRS	Q13332	1948 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	LCHN	A4D1U4	455 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442		I3L4J1	428 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	DNAJC6	O75061	913 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	AP1G2	O75843	785 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	UNC5C	O95185	931 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	NEK3	P51956	506 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	PRKAA2	P54646	552 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	SEMA3B	Q13214	749 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	DSC3	Q14574	896 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	GRTP1	Q5TC63	336 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	NPNT	Q6UXI9	565 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM35A	Q86V20	835 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	TET1	Q8NFU7	2136 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	MGARP	Q8TDB4	240 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	SUSD3	Q96L08	255 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	C7orf26	Q96N11	449 aa		12.12	□□□□□ -0.47
LETMD1-223	ENST00000550442	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		12.12	□□□□□ -0.47

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