RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516697.1

RNU6-180P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 180, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-180P, Length 61 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-180P-201ENST00000516697 CDH22Q9UJ99 828 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MAN1B1Q9UKM7 699 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 FBXO4Q9UKT5 387 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 POMT2Q9UKY4 750 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RARRES3Q9UL19 164 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 FZD4Q9ULV1 537 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MAFFQ9ULX9 164 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GABRQQ9UN88 632 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SH2B3Q9UQQ2 575 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PLAAQ9Y263 795 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TMX2Q9Y320 296 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HIVEP2P31629 2446 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 LMTK3Q96Q04 1460 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 A0A087X002 238 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DUXAA6NLW8 204 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 FOXO6A8MYZ6 492 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SMIM1B2RUZ4 78 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 FAM72CH0Y354 149 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 H7C4K7 107 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 J3KR12 359 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MYO1CO00159 1063 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 VWA5AO00534 786 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HSPB6O14558 160 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PRYO14603 147 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DVL1O14640 695 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CAPN9O14815 690 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HAT1O14929 419 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PLD2O14939 933 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 NPC1O15118 1278 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MDM4O15151 490 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SPTLC2O15270 562 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ARHGEF9O43307 516 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 AKAP10O43572 662 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MARCH6O60337 910 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DFNA5O60443 496 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SRGAP2O75044 1071 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 LRP3O75074 770 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RASSF9O75901 435 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 STK10O94804 968 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TJP3O95049 919 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ASMTLO95671 621 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RECKO95980 971 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 IGLV1-44P01699 117 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KRT6AP02538 564 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ANXA1P04083 346 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KRT6BP04259 564 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GNAI2P04899 355 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 EDN1P05305 212 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PROS1P07225 676 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TUBBP07437 444 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ALOX5P09917 674 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RARBP10826 455 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CDH1P12830 882 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SRCP12931 536 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ALADP13716 330 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GP9P14770 177 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DAOP14920 347 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CD1EP15812 388 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF17P17021 662 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 RXRAP19793 462 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ENPP1P22413 925 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ANOS1P23352 680 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 EDNRBP24530 442 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ACVR2AP27037 513 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 UQCRC1P31930 480 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 SLC16A2P36021 539 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 AVPR1AP37288 418 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PBX1P40424 430 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 IL15P40933 162 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 CCR10P46092 362 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KRT6CP48668 564 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 AMTP48728 403 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 PIK3CGP48736 1102 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MTHFSP49914 203 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 GATMP50440 423 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZNF84P51523 738 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 LOXL3P58215 753 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TIRAPP58753 221 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 KRTAP12-3P60328 96 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 ZP1P60852 638 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 WDR5P61964 334 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 TUBB4BP68371 445 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-180P-201ENST00000516697 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms