RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514344.5

CHD1-211, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CHD1, Length 2,955 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1-211ENST00000514344 OSER1Q9NX31 292 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 DERAQ9Y315 318 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 A0A1W2PQ27 194 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 A0A1W2PQ64 194 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 A0A1W2PQC6 194 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 D6RAR5 112 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 STMND1H3BQB6 276 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 PYGBP11216 843 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 XBP1P17861 261 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 SLC6A4P31645 630 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 TUBP50607 506 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 OVGP1Q12889 678 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 C16orf46Q6P387 395 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 C1orf186Q6ZWK4 172 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 IQCHQ86VS3 1027 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 SNX29Q8TEQ0 813 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 NKD1Q969G9 470 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 TSPAN18Q96SJ8 248 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 MTMR12Q9C0I1 747 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 C17orf75Q9HAS0 396 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 KLHL11Q9NVR0 708 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 RABGEF1Q9UJ41 708 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 DNM3Q9UQ16 869 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 NME7Q9Y5B8 376 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 PCSK5Q92824 1860 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 PP2D1A8MPX8 630 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 ANKRD63C9JTQ0 380 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 K7ENM7 598 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 TIMM44O43615 452 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 PLA2G4BP0C869 781 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 DRD2P14416 443 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 OAS2P29728 719 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 NOS2P35228 1153 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 KRT2P35908 639 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 C1orf61Q13536 156 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 FGL2Q14314 439 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 E2F5Q15329 346 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 NR0B2Q15466 257 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 MBLAC2Q68D91 279 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 KCNK18Q7Z418 384 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 ADIPOR2Q86V24 386 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 SLC34A3Q8N130 599 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 TOP6BLQ8N6T0 577 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 LMX1AQ8TE12 382 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 PTPRN2Q92932 1015 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 PMEPA1Q969W9 287 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 LURAP1Q96LR2 239 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 CEP295NLQ96MC4 621 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 CATSPER2Q96P56 530 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 PLIN2Q99541 437 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 MDFIQ99750 246 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 CMKLR1Q99788 373 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 FBRSQ9HAH7 460 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 USP29Q9HBJ7 922 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 GDAP2Q9NXN4 497 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 FZD4Q9ULV1 537 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 SCML1Q9UN30 329 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 CUBNO60494 3623 aa3.39□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 MKRN2OSH3BPM6 223 aa3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 AQP9O43315 295 aa3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 CLSTN1O94985 981 aa3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 PDGFAP04085 211 aa3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 CCL4P13236 92 aa3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 GUCY2CP25092 1073 aa3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 UGT1A3P35503 534 aa3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 ST8SIA6P61647 398 aa3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 KRT32Q14532 448 aa3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 NADK2Q4G0N4 442 aa3.38□□□□□ -1.87
CHD1-211ENST00000514344 PHF19Q5T6S3 580 aa3.38□□□□□ -1.87
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