RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504263.1

PCAT4-201, prostate cancer associated transcript 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCAT4, Length 2,091 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT4-201ENST00000504263 PEX3P56589 373 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MAP3K7CLP57077 242 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RPS8P62241 208 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 AMPD3Q01432 767 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CTBSQ01459 385 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 BAMBIQ13145 260 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PTGDRQ13258 359 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NR5A1Q13285 461 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRPC3Q13507 836 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PTK6Q13882 451 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TFDP1Q14186 410 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 DSC3Q14574 896 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 HERC3Q15034 1050 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ALX1Q15699 326 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SLC1A5Q15758 541 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CCNG2Q16589 344 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 C4orf46Q504U0 113 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FAM47CQ5HY64 1035 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RABGAP1LQ5R372 815 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TTC38Q5R3I4 469 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CLVS2Q5SYC1 327 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 C12orf60Q5U649 245 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FAM205BPQ63HN1 556 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TTBK2Q6IQ55 1244 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 UGT3A1Q6NUS8 523 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NEK5Q6P3R8 708 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CORO6Q6QEF8 472 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 XKR5Q6UX68 686 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 UNC5AQ6ZN44 842 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LRRC55Q6ZSA7 311 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 OTOP3Q7RTS5 596 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CD163Q86VB7 1156 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 HPS6Q86YV9 775 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ARMC8Q8IUR7 673 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TBC1D10CQ8IV04 446 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 HERC6Q8IVU3 1022 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NIM1KQ8IY84 436 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PPM1KQ8N3J5 372 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 UBL4BQ8N7F7 174 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 POU5F2Q8N7G0 328 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SNX31Q8N9S9 440 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GSTCDQ8NEC7 633 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SLC26A7Q8TE54 656 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NRBF2Q96F24 287 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CEP95Q96GE4 821 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CNBD2Q96M20 576 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 AK8Q96MA6 479 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KCNK16Q96T55 309 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 IER2Q9BTL4 223 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MKNK1Q9BUB5 465 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 SLC26A6Q9BXS9 759 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ANKRD60Q9BZ19 345 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NMUR2Q9GZQ4 415 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TRPV6Q9H1D0 765 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GANQ9H2C0 597 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NANOGQ9H9S0 305 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CXorf21Q9HAI6 301 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 AKIP1Q9NQ31 210 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PKD2L2Q9NZM6 624 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 KIF17Q9P2E2 1029 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ANAPC5Q9UJX4 755 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ZNRF3Q9ULT6 936 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 VPS4AQ9UN37 437 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 POMPQ9Y244 141 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 POLHQ9Y253 713 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GPSM3Q9Y4H4 160 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GJA3Q9Y6H8 435 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 LAMB2P55268 1798 aa3.6□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 A0A0G2JND7 137 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PI4K2BG5E9Z4 385 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 TAF4O00268 1085 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CCRL2O00421 344 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GIPC1O14908 333 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 PI15O43692 258 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 GAS2O43903 313 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 RFPL2O75678 378 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 DNAJB5O75953 348 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 ACSL3O95573 720 aa3.59□□□□□ -1.83
PCAT4-201ENST00000504263 CPNE6O95741 557 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms