RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 ATRIPQ8WXE1 791 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ALG14Q96F25 216 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PEBP4Q96S96 227 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 GABRG3Q99928 467 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa12.5□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ANKRD62A6NC57 917 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 DCLK1O15075 740 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 AXIN1O15169 862 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 APBB3O95704 486 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CYP1A2P05177 515 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TCF4P15884 667 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 GABRG2P18507 467 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 DGKEP52429 567 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ENPP2Q13822 863 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 LPAL2Q16609 132 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CA9Q16790 459 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PLEKHG6Q3KR16 790 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 MANEALQ5VSG8 457 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ASCL5Q7RTU5 278 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SLFN11Q7Z7L1 901 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 WDR5BQ86VZ2 330 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 LONP2Q86WA8 852 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 RASSF3Q86WH2 238 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CAMKK1Q8N5S9 505 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 UCMAQ8WVF2 138 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 HMGB4Q8WW32 186 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 RLN3Q8WXF3 142 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TTC17Q96AE7 1141 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 FAM122AQ96E09 287 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 MYO19Q96H55 970 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 MRGPRX3Q96LB0 322 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CD93Q9NPY3 652 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 NDFIP2Q9NV92 336 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ZNF212Q9UDV6 495 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 OR12D3Q9UGF7 316 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PCSK1NQ9UHG2 260 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 FZD10Q9ULW2 581 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 NEU3Q9UQ49 428 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 OR51B4Q9Y5P0 310 aa12.49□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 A0A0D9SEW6 157 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PROB1E7EW31 1015 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TIMM44O43615 452 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 AKR1B10O60218 316 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 LRIG2O94898 1065 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 MYBL1P10243 752 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 STK19P49842 368 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 NRLP54845 237 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CDH4P55283 916 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 MTA1Q13330 715 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ARL13BQ3SXY8 428 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SDE2Q6IQ49 451 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 LRRC31Q6UY01 552 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CNGA4Q8IV77 575 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 NTAN1Q96AB6 310 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TRIM11Q96F44 468 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 PSMB7Q99436 277 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 FEM1AQ9BSK4 669 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 NUP85Q9BW27 656 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 OSBPL2Q9H1P3 480 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TMEM245Q9H330 911 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 DEF6Q9H4E7 631 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 EBF1Q9UH73 591 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 ERVW-1Q9UQF0 538 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 SCINQ9Y6U3 715 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CKAP5Q14008 2032 aa12.48□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 LRCH4O75427 683 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 CLDN11O75508 207 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 EPHX1P07099 455 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 RHOCP08134 193 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 DLDP09622 509 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 NDUFV2P19404 249 aa12.47□□□□□ -0.41
NISCH-210ENST00000488157 GLDCP23378 1020 aa12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms