RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CTPS1-206ENST00000470271 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20.52■□□□□ 0.88
CTPS1-206ENST00000470271 HAPLN3Q96S86 360 aa20.52■□□□□ 0.88
CTPS1-206ENST00000470271 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.52■□□□□ 0.88
CTPS1-206ENST00000470271 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.52■□□□□ 0.88
CTPS1-206ENST00000470271 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.52■□□□□ 0.88
CTPS1-206ENST00000470271 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.52■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ANKRD62A6NC57 917 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 CBFA2T2O43439 604 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 CLDN11O75508 207 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 GZMAP12544 262 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 HLA-EP13747 358 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 BCKDHBP21953 392 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 IRAK1P51617 712 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 WDR59Q6PJI9 974 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC31Q6UY01 552 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 DMXL1Q9Y485 3027 aa20.51■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.873e-9■■■□□ 19
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF217O75362 1048 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 GYPCP04921 128 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 CDH4P55283 916 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ST8SIA6P61647 398 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 SPEM2Q0P670 501 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 RAB6CQ53S08 254 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 PMS2CLQ68D20 193 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 APCDD1Q8J025 514 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 FRMD1Q8N878 549 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 MCEEQ96PE7 176 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R9BQ96SB3 815 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 THADAQ6YHU6 1953 aa20.5■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 DRGXA6NNA5 263 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 E9PAM4 449 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 MAP3K13O43283 966 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 LRP3O75074 770 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 EPN2O95208 641 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 FTLP02792 175 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ADRA1BP35368 520 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 PLK1P53350 603 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 HDAC4P56524 1084 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ECT2LQ008S8 904 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 HGSNATQ68CP4 663 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF366Q8N895 744 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 KDM1BQ8NB78 822 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 MYO19Q96H55 970 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 PARVAQ9NVD7 372 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa20.49■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 SRGAP2O75044 1071 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 RTN2O75298 545 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 CNTN5O94779 1100 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 SERPING1P05155 500 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 COPAP53621 1224 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 MAMLD1Q13495 774 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ALFQ53S48 1182 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 OR2T3Q8NH03 318 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 CNPY3Q9BT09 278 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 PARD6AQ9NPB6 346 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 SUN2Q9UH99 717 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 USP18Q9UMW8 372 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa20.48■□□□□ 0.87
CTPS1-206ENST00000470271 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.47■□□□□ 0.87
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