RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 UCMAQ8WVF2 138 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 MPP6Q9NZW5 540 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 GMEB2Q9UKD1 530 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 RAB23Q9ULC3 237 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GVM2 712 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 TCAF2A6NFQ2 919 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 DRGXA6NNA5 263 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 FAM72CH0Y354 149 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 NPC1O15118 1278 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CCP110O43303 1012 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 EPN2O95208 641 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 F9P00740 461 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC172P0C7W6 258 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 GPD1P21695 349 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SDC4P31431 198 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 PTPN9P43378 593 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 STK19P49842 368 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 MAMLD1Q13495 774 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 FAM72BQ86X60 149 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CACUL1Q86Y37 369 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 TMPRSS6Q8IU80 811 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 DEFB119Q8N690 84 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf74Q96LT6 269 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 MCEEQ96PE7 176 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 NUP58Q9BVL2 599 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SELENOOQ9BVL4 669 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 TRIM7Q9C029 511 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 PRSS16Q9NQE7 514 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CYP8B1Q9UNU6 501 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 NEU3Q9UQ49 428 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 ERVW-1Q9UQF0 538 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 OR51B4Q9Y5P0 310 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CKAP5Q14008 2032 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SPAG17Q6Q759 2223 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 TTC34A8MYJ7 566 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 E9PAM4 449 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SRGAP2O75044 1071 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 FTLP02792 175 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 VAV1P15498 845 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CASP14P31944 242 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 ADRA1BP35368 520 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 PTGER3P43115 390 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CDH4P55283 916 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 STARD3Q14849 445 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 MANEALQ5VSG8 457 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 ARMCX6Q7L4S7 300 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 STRADAQ7RTN6 431 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 TMEFF1Q8IYR6 380 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 OR2T3Q8NH03 318 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 HAPLN3Q96S86 360 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 PSMB7Q99436 277 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 FEM1AQ9BSK4 669 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 RXFP3Q9NSD7 469 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SEMA4GQ9NTN9 838 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 PLA2G4CQ9UP65 541 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 GON4LQ3T8J9 2241 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CEP250Q9BV73 2442 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0D9SEW6 157 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SNAP91O60641 907 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 SIN3BO75182 1162 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4B-210ENST00000428861 CLDN11O75508 207 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms