RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF186Q9NXI6 227 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KANSL3Q9P2N6 904 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCTN4Q9UJW0 460 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM33Q9UPN9 1127 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HTTP42858 3142 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B4GALT3O60512 393 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLBP06746 335 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD68P34810 354 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRHR1P34998 444 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAB1Q13506 487 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PACS1Q6VY07 963 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF2BQ8N4N8 673 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OSBPL2Q9H1P3 480 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRHDEQ9UKU6 1024 aa19.18■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP12O75317 370 aa19.17■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TGDSO95455 350 aa19.17■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACLYP53396 1101 aa19.17■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC5A3P53794 718 aa19.17■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCTD11Q693B1 232 aa19.17■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MECRQ9BV79 373 aa19.17■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEU3Q9UQ49 428 aa19.17■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa19.17■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IRAK2O43187 625 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP2C18P33260 490 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEX44Q53QW1 395 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C4orf50Q6ZRC1 276 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF180Q86T96 592 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPF3Q92784 378 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VAT1Q99536 393 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD248Q9HCU0 757 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGS18Q9NS28 235 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCC13Q9NSE7 274 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHB8Q9UN66 801 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSAT1Q9Y617 370 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYO16Q9Y6X6 1858 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0G2JND7 137 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNFRSF10BO14763 440 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP5HO75947 161 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CABYRO75952 493 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CKBP12277 381 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFKB1P19838 968 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRIK1P39086 918 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPANXN3Q5MJ09 141 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPDYAQ5MJ70 313 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLB1LQ6UWU2 654 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CES3Q6UWW8 571 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM42Q8IWZ5 723 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGEC3Q8TD91 643 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CERS2Q96G23 380 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASS4Q9NQ75 786 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIRPGQ9P1W8 387 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VANGL2Q9ULK5 521 aa19.16■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT16P08779 473 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRGAP2BP0DMP2 458 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TARSP26639 723 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RASSF3Q86WH2 238 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF280BQ86YH2 543 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STKLD1Q8NE28 680 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACMSDQ8TDX5 336 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGLYRP2Q96PD5 576 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIK2Q9H0K1 926 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC40Q9H9A6 602 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNK13Q9HB14 408 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFATQ9P243 1243 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRCA2P51587 3418 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDHD2O94830 711 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6V1G2O95670 118 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLDP09622 509 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4Q2P0C623 313 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVK-10P10266 1014 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGFP49763 221 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DSC1Q08554 894 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLLU1OSQ5K130 101 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRMS1LQ5PSV4 323 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BTBD8Q5XKL5 378 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF449Q6P9G9 518 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAF7Q6Q0C0 670 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAAF3Q8N9W5 541 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HHIPL1Q96JK4 782 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEKT5Q96M29 485 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMOC2Q9H3U7 446 aa19.15■□□□□ 0.66
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BFARQ9NZS9 450 aa19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms