RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341403.9

UBXN8-202, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-202ENST00000341403 ATICP31939 592 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 HSPA1LP34931 641 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 EPS8Q12929 822 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 BNIP2Q12982 314 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 CAMK2BQ13554 666 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 KYAT1Q16773 422 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 COQ5Q5HYK3 327 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 FAM45BPQ6NSW5 357 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 RFX8Q6ZV50 586 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 PLPP6Q8IY26 295 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 FAM45AQ8TCE6 357 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 LPAR1Q92633 364 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 CASP10Q92851 521 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 ROPN1LQ96C74 230 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 CCDC126Q96EE4 140 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 RDH12Q96NR8 316 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 PSD2Q9BQI7 771 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 CORO1BQ9BR76 489 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 MECRQ9BV79 373 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 WDR41Q9HAD4 459 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 CYP4F11Q9HBI6 524 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 TMEM45AQ9NWC5 275 aa9.75□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 TISP43B9A030 160 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 ZBTB39O15060 712 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 SLC22A1O15245 554 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 ADCY6O43306 1168 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 DCXO43602 365 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 ATG7O95352 703 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 CPNE6O95741 557 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 POLBP06746 335 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 KITP10721 976 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 GPD1P21695 349 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 MIPP30301 263 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 HOXD12P35452 270 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 HALP42357 657 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 LIMK2P53671 638 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 BCAR1P56945 870 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 NAA20P61599 178 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 OGDHQ02218 1023 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 FOXM1Q08050 763 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 PTK2BQ14289 1009 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 SQLEQ14534 574 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 INPP5AQ14642 412 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 C16orf72Q14CZ0 275 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 LLGL1Q15334 1064 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 UGP2Q16851 508 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 XKR3Q5GH77 459 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 LIPMQ5VYY2 423 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 DCDC5Q6ZRR9 648 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 ANKRD52Q8NB46 1076 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 SEPT8Q92599 483 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF516Q92618 1163 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 PLEKHA8Q96JA3 519 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 CEP170P1Q96L14 293 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF778Q96MU6 729 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 UIMC1Q96RL1 719 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 TCF12Q99081 682 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 FTHL17Q9BXU8 183 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 COG4Q9H9E3 785 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 SPAG4Q9NPE6 437 aa9.74□□□□□ -0.85
UBXN8-202ENST00000341403 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms