RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.17■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 DNAI1Q9UI46 699 aa16.17■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CLEC4EQ9ULY5 219 aa16.17■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 DCLK1O15075 740 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 DAPK3O43293 454 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 SRFP11831 508 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 KRT10P13645 584 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 ERCC2P18074 760 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CXCR5P32302 372 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 SOX9P48436 509 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 HCAR3P49019 387 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 GAD2Q05329 585 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 IER5LQ5T953 404 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 RFX6Q8HWS3 928 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 RNF135Q8IUD6 432 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 PQLC3Q8N755 202 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 NAT16Q8N8M0 369 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CHFRQ96EP1 664 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 RNF157Q96PX1 679 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CD320Q9NPF0 282 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 NDFIP2Q9NV92 336 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 TMEM248Q9NWD8 314 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 DUSP12Q9UNI6 340 aa16.16■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CTAGE9A4FU28 777 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 ZNF487B1APH4 448 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CACNG3O60359 315 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CLDN11O75508 207 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 GJA4P35212 333 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 PTPN7P35236 360 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CDH4P55283 916 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 DYNLT1P63172 113 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CDH18Q13634 790 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 PPP2R5EQ16537 467 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 TFDP3Q5H9I0 405 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 MPP7Q5T2T1 576 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 KAZNQ674X7 775 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 VSIG1Q86XK7 387 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 MFN1Q8IWA4 741 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 NPWQ8N729 165 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 NETO2Q8NC67 525 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 DNASE1L2Q92874 299 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 HEMGNQ9BXL5 484 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 CARD9Q9H257 536 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 SNX12Q9UMY4 172 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.15■□□□□ 0.18
CCL25-201ENST00000253451 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 WASH4PA8MWX3 477 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 H0Y626 953 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TRIM24O15164 1050 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 MFSD11O43934 449 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 OPRD1P41143 372 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 NUMBP49757 651 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 COPS2P61201 443 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 KDSRQ06136 332 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ADCY2Q08462 1091 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 NR1H3Q13133 447 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 FSCBQ5H9T9 825 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 GJD3Q8N144 294 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 OSBPL9Q96SU4 736 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 KLC2Q9H0B6 622 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TRPV5Q9NQA5 729 aa16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 ESPNB1AK53 854 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 APOL1O14791 398 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TULP3O75386 442 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 RHOCP08134 193 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 OR1E1P30953 314 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CASQ1P31415 396 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 CD70P32970 193 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SLC6A11P48066 632 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 MAPKAPK2P49137 400 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 MESP2Q0VG99 397 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 LMAN2Q12907 356 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 SLC9A4Q6AI14 798 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TMCO3Q6UWJ1 677 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.13■□□□□ 0.17
CCL25-201ENST00000253451 PLD5Q8N7P1 536 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms