RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnaseh2bQ80ZV0 308 aa22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Maats1Q8BRC6 783 aa22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Etf1Q8BWY3 437 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TdrpQ8C5P7 182 aa22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PvrQ8K094 408 aa22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pitrm1Q8K411 1036 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrrc3bQ8VCH9 259 aa22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdha3Q91Y16 942 aa22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4930578G10RikQ9D4Q4 153 aa22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eml5Q8BQM8 1977 aa22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 DmdP11531 3678 aa22.48■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 DgkiD3YWQ0 1071 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc149F6V035 524 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nedd9O35177 833 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ndrg1Q62433 394 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lemd2Q6DVA0 511 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr20Q7TRX9 314 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mpp7Q8BVD5 576 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Adamts2Q8C9W3 1213 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ctage5Q8R311 779 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Srgap2Q91Z67 1071 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vangl2Q91ZD4 521 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Oas1cQ924S2 362 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kdelr1Q99JH8 212 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cyp2c55Q9D816 490 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q9D937 123 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ParvbQ9ES46 365 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zranb2Q9R020 330 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Il18rapQ9Z2B1 614 aa22.47■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kmt2bO08550 2713 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lrrc74aA0A1Y7VMD6 494 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm20431E9PY39 371 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm6205E9PZS2 359 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arfip1G5E8V9 373 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chrm1P12657 460 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CstaP56567 97 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arl4aP61213 200 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mrpl10Q3TBW2 262 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc185Q3V118 621 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fbxo39Q5NBU5 443 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q6PAC4 1279 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Snd1Q78PY7 910 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr213Q7TS32 327 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mageb18Q8BQR7 327 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sh3rf2Q8BZT2 735 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm6367Q8C6L9 287 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prl7b1Q8CGZ9 251 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Epn2Q8CHU3 595 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc12Q8R344 166 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Masp2Q91WP0 685 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tubb4aQ9D6F9 444 aa22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ssxb9A2BI93 185 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Aldoart1A6ZI46 419 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cisd3B1AR13 137 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm14496K7N5U4 849 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AfpP02772 605 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gja4P28235 333 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TubP50586 505 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PolgP54099 1218 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc38a5Q3U1J0 479 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pak4Q8BTW9 593 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ubr7Q8BU04 425 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr59Q8C0M0 992 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CcinQ8CDE2 588 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sirt5Q8K2C6 310 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PhykplQ8R1K4 467 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn1r64Q8R2B8 320 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tspan33Q8R3S2 283 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rprd1aQ8VDS4 312 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Akr1c14Q91WT7 323 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cybrd1Q925G2 290 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NapgQ9CWZ7 312 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ubqln5Q9D4I8 510 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scgb2b20Q9JI02 112 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Caln1Q9JJG7 219 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ThegQ9JMB1 375 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa22.45■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dmrta2A2A9A2 531 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nek2O35942 443 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 XlrP05531 208 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MaptP10637 733 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PrkchP23298 683 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TshrP47750 764 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc16a1P53986 493 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 IdsQ08890 552 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 9130409I23RikQ3TS87 320 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cct6bQ61390 531 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dpysl3Q62188 570 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sema4cQ64151 834 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AdalQ80SY6 360 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Timm29Q8BGX2 266 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Il17reQ8BH06 637 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Asb14Q8C6Y6 587 aa22.44■■□□□ 1.18
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Brd8Q8R3B7 951 aa22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.7 ms