Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
ParvbQ9ES46 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ParvbQ9ES46 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ParvbQ9ES46 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ParvbQ9ES46 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ParvbQ9ES46 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ParvbQ9ES46 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.8■■■■□ 3
ParvbQ9ES46 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ParvbQ9ES46 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ParvbQ9ES46 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ParvbQ9ES46 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ParvbQ9ES46 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ParvbQ9ES46 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ParvbQ9ES46 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ParvbQ9ES46 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ParvbQ9ES46 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ParvbQ9ES46 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
ParvbQ9ES46 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ParvbQ9ES46 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ParvbQ9ES46 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ParvbQ9ES46 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ParvbQ9ES46 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ParvbQ9ES46 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ParvbQ9ES46 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ParvbQ9ES46 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ParvbQ9ES46 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ParvbQ9ES46 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ParvbQ9ES46 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
ParvbQ9ES46 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ParvbQ9ES46 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
ParvbQ9ES46 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ParvbQ9ES46 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ParvbQ9ES46 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ParvbQ9ES46 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ParvbQ9ES46 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ParvbQ9ES46 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ParvbQ9ES46 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ParvbQ9ES46 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ParvbQ9ES46 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ParvbQ9ES46 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ParvbQ9ES46 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ParvbQ9ES46 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ParvbQ9ES46 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ParvbQ9ES46 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ParvbQ9ES46 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ParvbQ9ES46 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ParvbQ9ES46 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ParvbQ9ES46 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ParvbQ9ES46 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ParvbQ9ES46 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ParvbQ9ES46 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ParvbQ9ES46 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ParvbQ9ES46 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ParvbQ9ES46 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ParvbQ9ES46 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ParvbQ9ES46 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ParvbQ9ES46 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ParvbQ9ES46 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ParvbQ9ES46 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ParvbQ9ES46 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ParvbQ9ES46 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ParvbQ9ES46 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ParvbQ9ES46 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ParvbQ9ES46 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ParvbQ9ES46 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ParvbQ9ES46 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ParvbQ9ES46 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ParvbQ9ES46 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ParvbQ9ES46 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ParvbQ9ES46 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ParvbQ9ES46 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ParvbQ9ES46 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ParvbQ9ES46 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ParvbQ9ES46 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ParvbQ9ES46 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ParvbQ9ES46 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ParvbQ9ES46 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ParvbQ9ES46 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ParvbQ9ES46 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ParvbQ9ES46 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ParvbQ9ES46 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ParvbQ9ES46 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ParvbQ9ES46 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ParvbQ9ES46 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ParvbQ9ES46 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ParvbQ9ES46 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ParvbQ9ES46 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ParvbQ9ES46 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ParvbQ9ES46 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ParvbQ9ES46 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ParvbQ9ES46 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ParvbQ9ES46 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ParvbQ9ES46 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ParvbQ9ES46 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ParvbQ9ES46 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ParvbQ9ES46 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ParvbQ9ES46 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ParvbQ9ES46 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ParvbQ9ES46 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ParvbQ9ES46 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms