RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r39G3UWE6 305 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm21962L7N280 338 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pon1P52430 355 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vps45P97390 570 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 MroQ7TNB4 248 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q8CDN1 933 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rwdd4Q9CPR1 188 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nudt8Q9CR24 210 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q9D937 123 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt71Q9R0H5 524 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tubd1Q9R1K7 455 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rad9aQ9Z0F6 389 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sept3Q9Z1S5 350 aa12.08□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Banf1O54962 89 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ptpn1P35821 432 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 B3gntl1Q3U129 357 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kdm7aQ3UWM4 940 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pik3r5Q5SW28 871 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stx16Q8BVI5 326 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cpt1bQ924X2 772 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Yaf2Q99LW6 179 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trem2Q99NH8 227 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plin4O88492 1403 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 BC024978J3QPC3 361 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Coro1aO89053 461 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ephb3P54754 993 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Itga4Q00651 1039 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf112Q0VAW7 879 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tex35Q14BK3 207 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 AcrbpQ3V140 540 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tdrd5Q5VCS6 1040 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ehbp1Q69ZW3 1231 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Naaladl1Q7M758 745 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Chmp2bQ8BJF9 213 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r188Q8K3N2 308 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cplx3Q8R1B5 158 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rsph1Q8VIG3 301 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dlg2Q91XM9 852 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdc26Q99JP4 85 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rmi1Q9D4G9 616 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Neu2Q9JMH3 379 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 QkiQ9QYS9 341 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zbtb11G5E8B9 1050 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 GsrP47791 500 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gad2P48320 585 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il17reQ8BH06 637 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc134Q8C7V8 229 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spats2Q8K1N4 545 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Polr3hQ9D2C6 204 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc39a5Q9D856 535 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Calr3Q9D9Q6 380 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc40a1Q9JHI9 570 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tk2Q9R088 270 aa12.07□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plxna1P70206 1894 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 PorP37040 678 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tubgcp3P58854 905 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 RelaQ04207 549 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 IdsQ08890 552 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc185Q3V118 621 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nuak1Q641K5 658 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc39a4Q78IQ7 660 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr213Q7TS32 327 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 TdrkhQ80VL1 560 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajb13Q80Y75 316 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tceal5Q8CCT4 200 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ipo11Q8K2V6 975 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ces2aQ8QZR3 558 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pde6cQ91ZQ1 861 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Reep3Q99KK1 254 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 March2Q99M02 246 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 CoprsQ9CQ13 173 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nxnl2Q9D531 156 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc103Q9D9P2 237 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Numa1E9Q7G0 2094 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Usp2O88623 613 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Atxn10P28658 475 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rgs9bpQ148R9 237 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psg28Q4KL66 472 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 PrkciQ62074 595 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sp140Q6NSQ5 534 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1128Q7TR47 311 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trnau1apQ80VC6 287 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hmgxb4Q80Y32 594 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tusc3Q8BTV1 347 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam53cQ8BXQ8 393 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 TarsQ9D0R2 722 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Trpc4Q9QUQ5 974 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fut8Q9WTS2 575 aa12.06□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ap3d1O54774 1199 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prf1P10820 554 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Casp4P70343 373 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 PapolaQ61183 739 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbm22Q8BHS3 420 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbxo38Q8BMI0 1194 aa12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 63.4 ms