RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621456.2

SLC38A3-208, Transcript of solute carrier family 38 member 3, human

TSL 5

Gene SLC38A3, Length 635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A3-208	ENST00000621456	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	NUMA1	Q14980	2115 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456		H0Y626	953 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	ITPKA	P23677	461 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	MATK	P42679	507 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	ST8SIA6	P61647	398 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PTPRN	Q16849	979 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	ERICH1	Q86X53	443 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	KDM1B	Q8NB78	822 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	TTC17	Q96AE7	1141 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	C18orf8	Q96DM3	657 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	LMLN	Q96KR4	655 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	GAN	Q9H2C0	597 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		18.19	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	IGLV3-19	P01714	112 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	HLA-E	P13747	358 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	CSK	P41240	450 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	GABRB2	P47870	512 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	TPMT	P51580	245 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	COPA	P53621	1224 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	OXCT1	P55809	520 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PPM1J	Q5JR12	505 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	TAF3	Q5VWG9	929 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	SPAG5	Q96R06	1193 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	NUP58	Q9BVL2	599 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	COX16	Q9P0S2	106 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456		A0A1B0GVM2	712 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	LGALS16	A8MUM7	142 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PATE3	B3GLJ2	98 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456		M0QYT0	321 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	CFI	P05156	583 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	C7	P10643	843 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	IRX4	P78413	519 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	ZBTB16	Q05516	673 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	NME3	Q13232	169 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	SLC12A1	Q13621	1099 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	DEFB119	Q8N690	84 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	C4orf47	A7E2U8	309 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	TM4SF5	O14894	197 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	GFPT2	O94808	682 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	F9	P00740	461 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	SERPINF2	P08697	491 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	GNS	P15586	552 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	SOX5	P35711	763 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	ARID5B	Q14865	1188 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	NPY6R	Q99463	290 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	CD93	Q9NPY3	652 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	MEI4	A8MW99	385 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5

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