RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RGS10O43665 173 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PTP4A3O75365 173 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RPP40O75818 363 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CTDNEP1O95476 244 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TFRCP02786 760 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC192P0DO97 292 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ALOX12P18054 663 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNA3P22001 575 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 YY1P25490 414 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MAPK4P31152 587 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HOXD13P35453 343 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TDO2P48775 406 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.684e-11■□□□□ 10.1
CAPNS1-210ENST00000590211 DGKEP52429 567 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.682e-8■■■□□ 16.5
CAPNS1-210ENST00000590211 LILRA4P59901 499 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 DLG4P78352 724 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT17Q04695 432 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CSRP2Q16527 193 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NRN1LQ496H8 165 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GALNTL6Q49A17 601 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CAVIN4Q5BKX8 364 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP58Q5T655 872 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MFSD5Q6N075 450 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TMTC3Q6ZXV5 915 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CHST3Q7LGC8 479 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TBC1D10CQ8IV04 446 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 GALNT4Q8N4A0 578 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CREB3L4Q8TEY5 395 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RABGGTAQ92696 567 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNN1Q92952 543 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 MBD6Q96DN6 1003 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 BORCS6Q96GS4 357 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 PDLIM2Q96JY6 352 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 C8orf76Q96K31 380 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TTPALQ9BTX7 342 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 TLR10Q9BXR5 811 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 KRT23Q9C075 422 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HAUS2Q9NVX0 235 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 VPS28Q9UK41 221 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 HSF4Q9ULV5 492 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 SHOC2Q9UQ13 582 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa4.53□□□□□ -1.68
CAPNS1-210ENST00000590211 NID2Q14112 1375 aa4.53□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 NEDD4P46934 1319 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 STK36Q9NRP7 1315 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 FOCADQ5VW36 1801 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ERICH2A1L162 156 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC69A6NI79 296 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 KIF28PB7ZC32 967 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TOR1BO14657 336 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CTAGE5O15320 804 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 KLK10O43240 276 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB43O43298 467 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPAN3O60637 253 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM13O60858 407 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SGPL1O95470 568 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CER1O95813 267 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 LMNAP02545 664 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ITGB1P05556 798 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PTMAP06454 111 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 VDRP11473 427 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CHRM3P20309 590 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 LRPAP1P30533 357 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTN2P35609 894 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PGM1P36871 562 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CDK7P50613 346 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF134P52741 427 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ARF1P84077 181 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PDCLQ13371 301 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 NFYCQ13952 458 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 GPR68Q15743 365 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 UBXN11Q5T124 520 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 AKNAD1Q5T1N1 836 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MFSD4BQ5TF39 518 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX30Q5VWJ9 437 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ANO7Q6IWH7 933 aa4.52□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM173BQ6P4H8 233 aa4.52□□□□□ -1.69
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