RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 SGSHP51688 502 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 TKTL1P51854 596 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 SLC8A3P57103 927 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 GABREP78334 506 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 EHHADHQ08426 723 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 VAC14Q08AM6 782 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 E2F4Q16254 413 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF394Q53GI3 561 aa9.48□□□□□ -0.89
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PTPRM-210ENST00000578916 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.48□□□□□ -0.89
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PTPRM-210ENST00000578916 PIGZQ86VD9 579 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.48□□□□□ -0.89
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PTPRM-210ENST00000578916 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.48□□□□□ -0.89
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PTPRM-210ENST00000578916 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 MYO18BQ8IUG5 2567 aa9.48□□□□□ -0.89
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PTPRM-210ENST00000578916 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRM-210ENST00000578916 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-210ENST00000578916 DMAC2Q9NW81 257 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-210ENST00000578916 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRM-210ENST00000578916 STAT4Q14765 748 aa9.46□□□□□ -0.9
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PTPRM-210ENST00000578916 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-210ENST00000578916 CEP135Q66GS9 1140 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-210ENST00000578916 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-210ENST00000578916 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.46□□□□□ -0.9
PTPRM-210ENST00000578916 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
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