RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564547.1

TRAPPC2L-208, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC2L, Length 980 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ACSL4O60488 711 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ZNF202O95125 648 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 HARS2P49590 506 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 IRAK1P51617 712 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ENPEPQ07075 957 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SGO2Q562F6 1265 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ATL3Q6DD88 541 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 IL27RAQ6UWB1 636 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 RNF139Q8WU17 664 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SLC35C1Q96A29 364 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CDC6Q99741 560 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MIS12Q9H081 205 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ACP6Q9NPH0 428 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 FBXL12Q9NXK8 326 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DKK4Q9UBT3 224 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PCDHGA12O60330 932 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DNTTP04053 509 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ARID5AQ03989 594 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TAF5Q15542 800 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DCAF6Q58WW2 860 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 AHI1Q8N157 1196 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 STK40Q8N2I9 435 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SAP25Q8TEE9 199 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SLC39A13Q96H72 371 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PCED1AQ9H1Q7 454 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 USP25Q9UHP3 1055 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SARDHQ9UL12 918 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 A0A087WV48 116 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 A0A1W2PPC4 97 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 VILLO15195 856 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MYL1P05976 194 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 VDRP11473 427 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 RPL13P26373 211 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 GRK6P43250 576 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CCT8P50990 548 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TBX4P57082 545 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CST6Q15828 149 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ISM2Q6H9L7 571 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TMEM270Q6UE05 265 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 RRAGAQ7L523 313 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SCUBE3Q8IX30 993 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 EID2Q8N6I1 236 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 FIBINQ8TAL6 211 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PTPRN2Q92932 1015 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CETN3O15182 167 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 LTFP02788 710 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MYF5P13349 255 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 DRD3P35462 400 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PSMD8P48556 350 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 POM121L1PQ3SYA9 428 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 PCSK4Q6UW60 755 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TAC4Q86UU9 113 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 MFN1Q8IWA4 741 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SCML4Q8N228 414 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 GANCQ8TET4 914 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 TSC1Q92574 1164 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 SGK2Q9HBY8 427 aa14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2L-208ENST00000564547 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms