RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 POF1BQ8WVV4 589 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 RFFLQ8WZ73 363 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 C18orf8Q96DM3 657 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 NOX5Q96PH1 765 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 KCNK16Q96T55 309 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 MSRAQ9UJ68 235 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 GUCA1BQ9UMX6 200 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 IRAK3Q9Y616 596 aa8.45□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 MACROD2A1Z1Q3 448 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 F8VP50 259 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 H3BNC9 293 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 TEX28O15482 410 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 MTA2O94776 668 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 CXCL14O95715 111 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 CNPP09543 421 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 ACADSBP45954 432 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 NDUFV1P49821 464 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 HADHBP55084 474 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 SLC8A3P57103 927 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 CREMQ03060 361 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 TNK2Q07912 1038 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 ADCY1Q08828 1119 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 GPM6BQ13491 265 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 MAMLD1Q13495 774 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 RAB41Q5JT25 222 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 TPGS2Q68CL5 300 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 VSTM1Q6UX27 236 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 CDH24Q86UP0 819 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 XYLT1Q86Y38 959 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 C3orf20Q8ND61 904 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 ZNF461Q8TAF7 563 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 MYLIPQ8WY64 445 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 MCRS1Q96EZ8 462 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 HSFY1Q96LI6 401 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 TCF25Q9BQ70 676 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 MIS12Q9H081 205 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 PNPLA8Q9NP80 782 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 TLR9Q9NR96 1032 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 ST7Q9NRC1 585 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 COG5Q9UP83 839 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.44□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 EPOPA6NHQ4 379 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 HIDE1A8MVS5 230 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 GOLGA8SH3BPF8 625 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 BUB1O43683 1085 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 MOCS3O95396 460 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 GJB6O95452 261 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 SEC24AO95486 1093 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 LCP1P13796 627 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 ATF2P15336 505 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 CA8P35219 290 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 GPR15P49685 360 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 TKTL1P51854 596 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 SNX16P57768 344 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 ADIGQ0VDE8 80 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 DUSP4Q13115 394 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 DDR2Q16832 855 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.43□□□□□ -1.06
BEST3-211ENST00000552295 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms