RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 TXNDC9O14530 226 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PMPCBO75439 489 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 F2P00734 622 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 DGKAP23743 735 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SUOXP51687 545 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PRKAA2P54646 552 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ALS2CLQ60I27 953 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PPP4R4Q6NUP7 873 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 VPS33AQ96AX1 596 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 A0A087WWV3 80 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 GRAP2O75791 330 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FGF18O76093 207 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FTCDO95954 541 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 HNF1BP35680 557 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ARSEP51690 589 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 GULP1Q9UBP9 304 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 H3BQF6 201 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 NDUFB5O43674 189 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ELFN1P0C7U0 828 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 MLNP12872 115 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 STMN1P16949 149 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SCNN1AP37088 669 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 IL1RL1Q01638 556 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FIGNQ5HY92 759 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 POF1BQ8WVV4 589 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 RXFP2Q8WXD0 754 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CERS4Q9HA82 394 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GVM2 712 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TCAF2A6NFQ2 919 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 YKT6O15498 198 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CST8O60676 142 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CDK16Q00536 496 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 DSELQ8IZU8 1212 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 DUSP16Q9BY84 665 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SCML1Q9UN30 329 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ALPIP09923 528 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FGFR4P22455 802 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 KCNA5P22460 613 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 GBP5Q96PP8 586 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FAM86B1E9PN63 330 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 H3BNH8 94 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 APRTP07741 180 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF24P17028 368 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ATP6V1C1P21283 382 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 TMPRSS15P98073 1019 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms