RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 CYTH3O43739 400 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FTH1P02794 183 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SLC2A4P14672 509 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 NPR3P17342 541 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 HLA-DPA1P20036 260 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ICAM3P32942 547 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CASP4P49662 377 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ADIGQ0VDE8 80 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TMED1Q13445 227 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 LHX5Q9H2C1 402 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 KCTD10Q9H3F6 313 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 GDF3Q9NR23 364 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 AIM2O14862 343 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 WDR47O94967 919 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 JCHAINP01591 159 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 YY1P25490 414 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 OR1E1P30953 314 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 GPC1P35052 558 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 RHBDL3P58872 404 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 NUP93Q8N1F7 819 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PGM2Q96G03 612 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 RGS18Q9NS28 235 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 UBDO15205 165 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 DDR1Q08345 913 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 NFYCQ13952 458 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MLXIPLQ9NP71 852 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 AK9Q5TCS8 1911 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 NEK5Q6P3R8 708 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SRLQ86TD4 932 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 MIB1Q86YT6 1006 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SENP8Q96LD8 212 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM111AQ96PZ2 611 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 THTPAQ9BU02 230 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM22K7EJ46 135 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TRIM13O60858 407 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 POMCP01189 267 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CNPP09543 421 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 PTPN4P29074 926 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 RAP1GAPP47736 663 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ASAH2Q9NR71 780 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0A0MRY4 1105 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CBX4O00257 560 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 DARSP14868 501 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SERPINB5P36952 375 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ST3GAL1Q11201 340 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 GPR142Q7Z601 462 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 FIBCD1Q8N539 461 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SUSD6Q92537 303 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 THAP11Q96EK4 314 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 SPATA13Q96N96 652 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ZBTB14O43829 449 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 GCATO75600 419 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CATP04040 527 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TCF3P15923 654 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 TTPAP49638 278 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 IRAK1P51617 712 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 ALG11Q2TAA5 492 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 LGI2Q8N0V4 545 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRB-208ENST00000550358 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms