RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544547.5

LIMS1-215, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 4,461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-215ENST00000544547 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 TYROBPO43914 113 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 HMGCRP04035 888 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 STT3AP46977 705 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 RALGDSQ12967 914 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 PPM1JQ5JR12 505 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 TMC7Q7Z402 723 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 DSELQ8IZU8 1212 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 BEST2Q8NFU1 509 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 UBP1Q9NZI7 540 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 ITGA11Q9UKX5 1188 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 RAB26Q9ULW5 256 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 MRASO14807 208 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 UBDO15205 165 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 PTGER2P43116 358 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 MSS51Q4VC12 460 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 ARCQ7LC44 396 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 IL31RAQ8NI17 732 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 DLG3Q92796 817 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 PARVBQ9HBI1 364 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 FAM149AA5PLN7 773 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 TMEM63AO94886 807 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 CHEK2O96017 543 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 PSME3P61289 254 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 NFIL3Q16649 462 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 CHSY1Q86X52 802 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 FSD1LQ9BXM9 530 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 CROTQ9UKG9 612 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.54□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 TPH1P17752 444 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 CDH8P55286 799 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 BOLA3Q53S33 107 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 MKL1Q969V6 931 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 ATG4CQ96DT6 458 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 PHF21BQ96EK2 531 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 OSBPL11Q9BXB4 747 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 TRPC5OSA6NMA1 111 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 ITGB5P18084 799 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 S100A5P33763 92 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 DGCR6Q14129 220 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 MYLK3Q32MK0 819 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 HELQQ8TDG4 1101 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 FAM151AQ8WW52 585 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 POLIQ9UNA4 740 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 CCNA2P20248 432 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 EMC2Q15006 297 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 CYP51A1Q16850 503 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 KLHL35Q6PF15 583 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 TMEM110Q86TL2 294 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 SKA1Q96BD8 255 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 FAM136AQ96C01 138 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 C1orf50Q9BV19 199 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 COPG2Q9UBF2 871 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 GFAPP14136 432 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 GP5P40197 560 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 SPATA33Q96N06 139 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 ASNA1O43681 348 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 SNX2O60749 519 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 CD48P09326 243 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 MYL4P12829 197 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 CNTFP26441 200 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 MAP3K10Q02779 954 aa14.52□□□□□ -0.08
LIMS1-215ENST00000544547 BNIP3Q12983 259 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms