RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 MYO6Q9UM54 1294 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 SAMD9Q5K651 1589 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 OR2W5A6NFC9 320 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 FGFR2P21802 821 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 NFATC4Q14934 902 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 SLC5A9Q2M3M2 681 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 TTC39AQ5SRH9 613 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 USP43Q70EL4 1123 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 BEND5Q7L4P6 421 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 INPP5DQ92835 1189 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 LMLNQ96KR4 655 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa5.47□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa5.47□□□□□ -1.53
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SGCE-211ENST00000522045 TGM2P21980 687 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 GALEQ14376 348 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CYB5RLQ6IPT4 315 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PARM1Q6UWI2 310 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 TRILQ7L0X0 811 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CYB5R4Q7L1T6 521 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 MORC1Q86VD1 984 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 SNX27Q96L92 541 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PCDHAC1Q9H158 963 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 SPAG4Q9NPE6 437 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 OBP2AQ9NY56 170 aa5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 FANCD2Q9BXW9 1451 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 ARHGEF11O15085 1522 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 TOPBP1Q92547 1522 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 POM121BA6NF01 834 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 IFITM10A6NMD0 228 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 M0QZQ0 153 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PPP6R2O75170 966 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CNTN5O94779 1100 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 NFATC1O95644 943 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 RAP1GAP2Q684P5 730 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 NADSYN1Q6IA69 706 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 HMBOX1Q6NT76 420 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 C16orf89Q6UX73 402 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 C7orf57Q8NEG2 295 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 ZNF347Q96SE7 839 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 ISCUQ9H1K1 167 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 GJB4Q9NTQ9 266 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 MDFICQ9P1T7 246 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 MYO1AQ9UBC5 1043 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 HFM1A2PYH4 1435 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 FMN1Q68DA7 1419 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 FGD6Q6ZV73 1430 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 AKNAQ7Z591 1439 aa5.45□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 KDM5BQ9UGL1 1544 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 GAGE12JA6NER3 117 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PODXLO00592 558 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 KLKB1P03952 638 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 HOXC6P09630 235 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 EGR1P18146 543 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 ZNF543Q08ER8 600 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 FHOD3Q2V2M9 1422 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 C9orf50Q5SZB4 431 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PHF21BQ96EK2 531 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PTPN23Q9H3S7 1636 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 GRIN2BQ13224 1484 aa5.44□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 UACAQ9BZF9 1416 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 FOXO6A8MYZ6 492 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 NPC1O15118 1278 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 CPA1P15085 419 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 TSHRP16473 764 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 PIK3CBP42338 1070 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 RGS19P49795 217 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 GAS1P54826 345 aa5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 RRP1P56182 461 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
SGCE-211ENST00000522045 SLC37A1P57057 533 aa5.43□□□□□ -1.54
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