RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 MYCT1Q8N699 235 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ASB7Q9H672 318 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 PARVGQ9HBI0 331 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 C2CD2Q9Y426 696 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 KIF3AQ9Y496 699 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 X6R8D5 127 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.86□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 LRP3O75074 770 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 SOAT2O75908 522 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 FGF19O95750 216 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 RETP07949 1114 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 NMT1P30419 496 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ADSSP30520 456 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ABCD1P33897 745 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 UBA7P41226 1012 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ALDH1A3P47895 512 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 SATB1Q01826 763 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 DMWDQ09019 674 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 LCE1DQ5T752 114 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 USP37Q86T82 979 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 GPBP1Q86WP2 473 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 CXorf38Q8TB03 319 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 RAD54LQ92698 747 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 BICD1Q96G01 975 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 TASP1Q9H6P5 420 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 NCDNQ9UBB6 729 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIP11Q15643 1979 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 LAMA1P25391 3075 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 TISP43B9A030 160 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 H7BY64 318 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 K7ENM7 598 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 CYB561D2O14569 222 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 PRODHO43272 600 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 DLX3O60479 287 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 PRAMEF12O95522 483 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 BMP15O95972 392 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 CAPNS1P04632 268 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 C8BP07358 591 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ODC1P11926 461 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ATF6P18850 670 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 GABRR2P28476 465 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 HOXC13P31276 330 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 CNR2P34972 360 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ACOT2P49753 483 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 SMARCB1Q12824 385 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 PTPAQ15257 358 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 VWA3BQ502W6 1294 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR158Q5T848 1215 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 WSCD1Q658N2 575 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 Q6ZS52 159 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 USP49Q70CQ1 688 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ITIH5Q86UX2 942 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 SYT8Q8NBV8 401 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 CHFRQ96EP1 664 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 CALML4Q96GE6 196 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF40A-210ENST00000489741 PKMYT1Q99640 499 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms