RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TET1	Q8NFU7	2136 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ASB2	Q96Q27	587 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	HIPK3	Q9H422	1215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PADI4	Q9UM07	663 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ASTN1	O14525	1302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941		F5H697	171 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ERC2	O15083	957 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ORC4	O43929	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MCC	P23508	829 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MPG	P29372	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	NOV	P48745	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCT8	P50990	548 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SP2	Q02086	613 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAB39A	Q14964	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ODF1	Q14990	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ETFDH	Q16134	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	NAPB	Q9H115	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	MYH6	P13533	1939 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ICAM1	P05362	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CHRM3	P20309	590 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	NDUFV1	P49821	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCL23	P55773	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PIGF	Q07326	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TCF15	Q12870	199 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACAP2	Q15057	778 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ALX1	Q15699	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	SMO	Q99835	787 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TRANK1	O15050	2925 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941		B4DLN1	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	PPM1D	O15297	605 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	KCNAB3	O43448	404 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	NMT2	O60551	498 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	VPS4B	O75351	444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	KIF20A	O95235	890 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TNKS	O95271	1327 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	ACTN1	P12814	892 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	CPE	P16870	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	KEL	P23276	732 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SNRNP40-205	ENST00000486941	RFC2	P35250	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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